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![RNAi醫(yī)學(xué)信息數(shù)據(jù)庫(kù)的研究.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/13/6cb35161-dbb8-4524-bf5e-72cf9102ed41/6cb35161-dbb8-4524-bf5e-72cf9102ed411.gif)
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1、背景和目的: 作為新興的基因阻斷技術(shù),越來(lái)越多的研究單位和公司都采用RNAi技術(shù)平臺(tái)來(lái)研究基因功能,篩選藥物或疾病的靶基因,核心進(jìn)展是特定基因組RNAi文庫(kù)的建立,為我們能夠進(jìn)行人類(lèi)細(xì)胞的全基因組掃描奠定基礎(chǔ),是一項(xiàng)具有重要實(shí)用使用價(jià)值的研究。 RNAi技術(shù)涉及多個(gè)學(xué)科的交叉,醫(yī)學(xué),生物等相關(guān)領(lǐng)域的工作人員都可以利用RNAi技術(shù)進(jìn)行研究工作,目前運(yùn)用RNAi技術(shù)進(jìn)行研究的工作正大量的成倍的增長(zhǎng),因此建立的RNAi信息數(shù)據(jù)
2、庫(kù)能使相關(guān)研究人員可以快捷、及時(shí)地獲得已通過(guò)RNAi沉默的基因和靶序列,這對(duì)相關(guān)人員就有非常大的意義。此外,還可以在互聯(lián)網(wǎng)上接受有關(guān)科研人員提交的相關(guān)基因研究信息,使數(shù)據(jù)庫(kù)更加豐富。 在數(shù)據(jù)庫(kù)操作系統(tǒng)選擇過(guò)程中,Linux下MYSQL+PHP建立的數(shù)據(jù)庫(kù)存在不直觀,數(shù)據(jù)類(lèi)型不足,且對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的修改操作過(guò)程復(fù)雜等缺點(diǎn),為了使用戶(hù)可以方便、快捷地使用本數(shù)據(jù)庫(kù),軟件設(shè)計(jì)采用了動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)庫(kù)交互結(jié)構(gòu),外部用戶(hù)通過(guò)互聯(lián)網(wǎng)使用通用的瀏覽器就可以訪
3、問(wèn)數(shù)據(jù)庫(kù)。 本實(shí)驗(yàn)希望通過(guò)Windowssever2003下SQL2000+PHP構(gòu)建一個(gè)WEB數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)實(shí)現(xiàn)特定基因組RNAi的資料搜集,將所有基因信息下載到本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)中,人工搜索文獻(xiàn)并提交的方法更新數(shù)據(jù)庫(kù)。此法的優(yōu)點(diǎn)是可以自主、靈活地顯示數(shù)據(jù)庫(kù)的內(nèi)容,并檢測(cè)其是否能提供最直接、最經(jīng)濟(jì)和最有效地在特定基因組范圍內(nèi)進(jìn)行基因序列和功能篩選。 本研究的目的是建立一個(gè)較完整確切的已有文獻(xiàn)支持的RNAi相關(guān)醫(yī)學(xué)信息數(shù)據(jù)庫(kù),并為以后
4、后續(xù)的研究打下基礎(chǔ)。 方法: 1.RNAi醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的軟件開(kāi)發(fā)平臺(tái):包括windowsserver2003,Microsoftsqlserver2000,php5.1+ⅡS6,PHP腳本安裝運(yùn)行過(guò)程三個(gè)部分。 2.RNAi醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)部開(kāi)發(fā):包括建立數(shù)據(jù)庫(kù)和數(shù)據(jù)表,數(shù)據(jù)庫(kù)的外部連接。 3.數(shù)據(jù)庫(kù)的外部應(yīng)用:包括數(shù)據(jù)庫(kù)的登錄,提交數(shù)據(jù)庫(kù)界面,基因檢索界面三部分。 結(jié)果: 1.成功安裝wind
5、owsserver2003,Microsoftsqlserver2000,php5.1+ⅡS6,PHP三個(gè)軟件。 2.用SQLserver2000建立了RNAi數(shù)據(jù)庫(kù),并用PHP設(shè)計(jì)瀏覽器端和服務(wù)器端的連接,使PHP與數(shù)據(jù)庫(kù)動(dòng)態(tài)鏈接起來(lái).再經(jīng)過(guò)ⅡS6.0發(fā)布于internet之后,使用戶(hù)可以通過(guò)瀏覽器對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行訪問(wèn),添加,查詢(xún)等操作。 3.建立了可以同時(shí)顯示干擾基因,GeneTarget,PositionfromATG
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