DNA條形碼在喇叭河和瓦屋山兩棲爬行類(lèi)物種多樣性調(diào)查中的應(yīng)用研究.pdf_第1頁(yè)
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1、為調(diào)查四川省瓦屋山省級(jí)自然保護(hù)區(qū)和喇叭河省級(jí)自然保護(hù)區(qū)內(nèi)的兩棲爬行類(lèi)物種的多樣性,并進(jìn)一步驗(yàn)證DNA條形碼技術(shù)的可靠性以及COⅠ基因序列作為標(biāo)記基因的可行性。本文對(duì)這兩個(gè)保護(hù)區(qū)內(nèi)的兩棲類(lèi)和爬行類(lèi)物種進(jìn)行了采樣,共采集到239個(gè)樣本,使用傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)方法和DNA條形碼技術(shù)對(duì)采集到的樣本做出鑒定。以?xún)蓷?lèi)DNA條形碼COⅠ序列通用引物擴(kuò)增樣本的COⅠ序列作為標(biāo)記基因,同時(shí)使用通用引物擴(kuò)增樣本的16SrRNA和Cyt b序列作為補(bǔ)充序列。研究

2、結(jié)果如下:
  喇叭河自然保護(hù)區(qū)共鑒定物種12種,其中兩棲綱2目5科7種,爬行綱2目3科5種;瓦屋山自然保護(hù)區(qū)共鑒定物種26種,其中兩棲綱2目6科18種,爬行綱1目2科8種。在所有被鑒定的物種中,除了一個(gè)齒蟾屬物種的3個(gè)樣本無(wú)法做出準(zhǔn)確鑒定以及一個(gè)銅蜓蜥物種的樣本存在隱存種的可能性需要進(jìn)一步研究以外,其余物種均做出準(zhǔn)確鑒定。本文將測(cè)得的序列上傳至GenBank中,如大齒蟾、經(jīng)甫樹(shù)蛙和瓦屋山腹鏈蛇等11個(gè)物種的COⅠ序列都是第一次被

3、測(cè)得,這些序列的上傳能夠?yàn)橐院蟮腄NA條形碼研究提供數(shù)據(jù)。本文研究表明,Che等發(fā)表的兩棲類(lèi)DNA條形碼通用引物很好的解決了兩棲類(lèi)中存在的引物通用性問(wèn)題,并且相比較于16SrRNA基因,COⅠ基因在兩棲爬行類(lèi)DNA條形碼鑒定中是更適合的標(biāo)記基因,這和先前的研究結(jié)果是一致的,但本文同時(shí)也發(fā)現(xiàn),在目前階段,GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中COⅠ序列的數(shù)據(jù)還遠(yuǎn)未完善以及數(shù)據(jù)庫(kù)中有更多的16S序列,補(bǔ)充測(cè)定16S、Cytb等序列能夠更好、更準(zhǔn)確的對(duì)物種做

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