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![雌激素代謝相關(guān)基因位點及其單倍型與中國漢族女性初潮年齡的群體關(guān)聯(lián)分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-2/24/12/5eeb4351-ed53-4417-8a22-525492cf7e20/5eeb4351-ed53-4417-8a22-525492cf7e201.gif)
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文檔簡介
1、【目的】
通過對歐美人群中多次證實與初潮年齡相關(guān)的雌激素合成與代謝相關(guān)的基因如細胞色素P450家族19A1(cytochrome P450, family19, subfamily A, polypeptide1,CYP19A1),雌激素受體1(estrogen receptor1,ESR1),雌激素受體2(estrogen receptor2,ESR2)及孕酮受體(progesterone receptor,PGR)共4個基
2、因及其多態(tài)性位點的基因分型,了解上海及其周邊地區(qū)無親緣關(guān)系的漢族女性初潮年齡的頻率分布及其初潮年齡早晚的變異關(guān)系。
【資料與方法】
通過對2011年12月至2012年5月來我院體檢上海及其周邊地區(qū)2000多例健康成年女性面對面問卷形式搜集基本信息資料,包括年齡、民族、身高、體重、既往病史等,對所有研究對象記錄其初潮年齡、生育、哺乳、避孕藥的應(yīng)用等,并提取外周血基因組DNA。利用國際人類基因組計劃數(shù)據(jù)庫(Hapmap)
3、,設(shè)定連鎖不平衡系數(shù)r2>0.8,最小等位基因頻率(MAF)>0.05,選取CYP19A1、ESR1、ESR2、PGR共4個基因的24個SNP位點(rs12148604、rs2255192、rs4646、rs2470144、rs6493496、rs2470176、rs700519、rs28757184、rs8029807、rs1062577、rs3798577、rs9340799、rs2234693、rs2228480、rs377808
4、2、rs3798758、rs928554、rs1255998、rs8018687、rs4986938、rs1256049、rs484389、rs518162、rs1042838),使用SNP scan分型技術(shù)鑒定1791例標本的24個SNP分型。并對全部病例資料進行運用群體關(guān)聯(lián)分析方法如卡方檢驗、逐步回歸分析、線性回歸分析、ANOVA法等方法分析該4個基因及其多態(tài)性位點與女性初潮年齡的關(guān)系,并通過PLINK分析軟件計算各位點間的連鎖不平
5、衡關(guān)系及其單倍型塊與初潮年齡早晚差異的關(guān)系。
【結(jié)果】
本研究人群中,除rs1062577和rs3798758外,其余22個等位基因和基因型分布符合Hardy-Weinberg定律。采用單因素方差(ANOVA)分析:rs6493496與初潮年齡早晚的差異P值接近0.05(p=0.056),可能是初潮年齡變異的易感位點,rs3798577可見年齡分層(P=0.042),rs518162可見身高分層(P=0.047);而
6、線性回歸分析顯示:rs6493496與初潮年齡早晚的差異有統(tǒng)計學意義(p=0.01038),其余23個等位基因型和單倍型分析未發(fā)現(xiàn)與初潮年齡早晚變異間存在相關(guān)性。
【結(jié)論】
1.本研究首次分析了CYP19A1、ESR1、ESR2、PGR這四個基因SNPs及其單倍型與上海及其周邊地區(qū)無親緣關(guān)系的女性初潮年齡早晚變異的關(guān)系;2.本研究發(fā)現(xiàn)CYP19A1基因的rs6493496位點可能是該地區(qū)女性初潮年齡早晚變異的易感位點
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