極地抗植物病原真菌活性菌株P(guān)KS和NRPS基因的克隆與步移.pdf_第1頁(yè)
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1、極地是一個(gè)微生物資源寶庫(kù),其微生物具有種質(zhì)的新穎性和多樣性。由于極地特殊的環(huán)境特征,有可能從生存于其中的極地微生物中發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)新穎的生物活性物質(zhì)。對(duì)極地微生物活性物質(zhì)生物合成的有關(guān)功能基因進(jìn)行研究,可為從生物合成途徑深入研究其次級(jí)代謝產(chǎn)物提供分子生物學(xué)的證據(jù),并為今后其開發(fā)利用極地微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物的生物合成提供基因資源。
  以尖孢鐮刀菌為指示菌,采用平板擴(kuò)散法對(duì)實(shí)驗(yàn)室保藏的38株極地活性菌株進(jìn)行了活性驗(yàn)證。研究結(jié)果表明,38株極

2、地菌株中,有13株極地菌株抑菌活性穩(wěn)定且明顯,其中菌株C-1、11W、83-1、195、2-Z18和P406抑菌效果較好。對(duì)研究獲得的抑菌活性顯著且穩(wěn)定的13株極地菌株進(jìn)行了基于16s rRNA基因的分子鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析。結(jié)果表明,13株活性菌株分別屬于3個(gè)屬;其中11株屬于假單胞屬(Pseudomonas),1株屬于嗜冷桿菌屬(Psychrobacter),1株屬于節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)。
  分別利用簡(jiǎn)并引物P

3、KS-D/PKS-U和NRPS-D/NRPS-U對(duì)13株極地活性菌株進(jìn)行了多聚酮合酶(PKS)和非核糖體肽合成酶(NRPS)基因的擴(kuò)增。研究結(jié)果表明,在13株活性菌株中,從5株菌株中擴(kuò)增到PKS I型KS結(jié)構(gòu)域片段,陽(yáng)性率為38.5%;從10株菌株中擴(kuò)增到NRPS基因A結(jié)構(gòu)域片段,陽(yáng)性率為76.9%;從5株活性菌株(C-1、P499、83-1、P406和205)同時(shí)克隆到PKS和NRPS基因,菌株C-1和P499均擴(kuò)增出2條NRPS基因

4、片段,都值得進(jìn)一步深入研究。
  選取菌株P(guān)seudomonas sp.83-1為研究對(duì)象,利用基因步移技術(shù)對(duì)其NRPS和PKS基因兩側(cè)未知序列分別進(jìn)行了擴(kuò)增。研究結(jié)果表明,對(duì)菌株P(guān)seudomonas sp.83-1 NRPS基因成功進(jìn)行了4次步移,向其5′端共延伸5118bp;對(duì)菌株P(guān)seudomonas sp.83-1 PKS基因成功進(jìn)行了2次步移,向其5′端共延伸1622bp。對(duì)經(jīng)基因步移后獲得的NRPS基因序列進(jìn)行了OR

5、F的分析,共發(fā)現(xiàn)3個(gè)較為完整的ORF;其中ORF1編碼了NRPS模塊中的A(adenylation)域,ORF2編碼了NRPS模塊中的C(condensation)域,ORF3編碼了NRPS模塊中的1個(gè)A域和2個(gè)C域。
  本實(shí)驗(yàn)對(duì)極地抗植物病原真菌活性菌株的PKS和NRPS基因的研究取得了一定的進(jìn)展,為從聚酮和非核糖體肽等生物合成途徑深入研究活性菌株的次級(jí)代謝產(chǎn)物提供了基因?qū)W證據(jù),有利于進(jìn)一步了解代謝產(chǎn)物的分子調(diào)控機(jī)制,預(yù)測(cè)可能

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