1、多肽類藥物在治療心血管疾病、癌癥、內分泌類疾病、代謝類疾病、血液病、傳染性疾病和疼痛緩解等眾多方面都有顯著的療效和廣泛的應用前途。與有機小分子化學藥物相比，多肽類藥物往往更為溫和、副作用小、特異性強，不會引發(fā)嚴重的免疫反應。隨著藥物化學和生命科學的快速發(fā)展，近年來多肽類藥物的研究和開發(fā)也表現(xiàn)出快速發(fā)展的趨勢。肽類藥物定量構效關系(Quantitative Structure-Activity Relationship，QSAR)就是應用

2、數(shù)學統(tǒng)計學方法來定量描述肽類藥物或其類似物的化學結構與特定的肽藥物活性之間的關系。采取實驗測量評估肽類藥物活性的方法極大的耗費人力和時間，因此肽類藥物定量構效關系在肽類藥物的研發(fā)中有重要的意義。在肽類藥物定量構效關系中最為重要的就是肽藥物結構的表征。因為肽類藥物的空間結構和功能活性信息大都取決于其一級結構及氨基酸序列，因此，氨基酸描述符的選擇和建立對肽類藥物 QSAR的研究至關重要。本論文內容包括以下三部分：
　　第一部分本文從2

3、0種天然氨基酸的41個分子輪廓指數(shù)(randic molecular profiles)、44個分子特征值指數(shù)(eigenvalue based indices)和47個分子運轉路徑數(shù)目(walk and path counts)分別進行主成分分析，得出一種新的氨基酸描述符-SVREW。用 SVREW描述符表征抗菌肽、苦味肽、ACE抑制肽、后葉催產素類似物、HLA-A*0201限制性 CTL表位肽等典型的多肽藥物。采用逐步回歸結合多元線

4、性回歸(stepwise linear regression-multiple linear regression，SMR-MLR)建立定量構效關系模型，同時采用內外部雙重驗證的方法來檢驗模型的穩(wěn)定性。經研究表明，SVREW描述符用于肽分子結構表征所建模型穩(wěn)定性與預測能力均較好，有望成為多肽定量構效關系研究中一種有效的結構表征方法，并對新藥物的發(fā)現(xiàn)和研究提供指導。
　　第二部分采用比較分子場分析(CoMFA)的方法、比較分子相似性

5、指數(shù)分析(CoMSIA)的方法、全息定量構效關系(HQSAR)的方法研究了150個血管緊張素轉化酶(Angiotensin Converting Enzyme，ACE)抑制三肽降壓活性與分子結構之間的關系。并且采用分子對接技術研究ACE抑制三肽與受體ACE酶相互作用的機理和方式。結果表明，立體場和靜電場是影響ACE第三部分本文提出利用三維原子場相互作用矢量（3D-Holographic Vector of Atomic Interact