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文檔簡介
1、葉綠體是綠色植物以及真核藻類的一種特定的亞細胞器,也是植物細胞所特有的能量轉換器,它在植物光合作用和新陳代謝中起到了重要作用。了解蛋白質(zhì)的亞葉綠體定位對研究葉綠體蛋白質(zhì)的功能及其與其他大分子的相互作用具有重要的意義。
本文計算了亞葉綠體蛋白質(zhì)的氨基酸組分分段信息、化學位移關聯(lián)信息、基于分子功能和生物過程的GO注釋信息、蛋白質(zhì)保守位點的進化信息,并使用二項分布作為特征篩選方法,對三肽組分進行特征篩選出最優(yōu)特征,以構建葉綠體蛋白質(zhì)
2、的特征參數(shù)。最后將這些特征信息進行融合,結合支持向量機算法構建分類預測模型,在Jackknife檢驗下的總體預測成功率達到90.2%。同時在交叉檢驗和獨立測試下都得到了較好的預測效果。通過與其他研究者所提出的方法進行多方面預測性能對比,證明了本文所提出方法具有優(yōu)良性能。本文還構建了擬南芥蛋白質(zhì)的亞葉綠體定位數(shù)據(jù)集,根據(jù)植物蛋白質(zhì)的亞葉綠體定位數(shù)據(jù)集S60的預測中,挑選出具有較好預測效果的特征參數(shù)即蛋白質(zhì)保守位點的進化信息和基于分子功能和
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