急性肝衰竭小鼠回腸、結(jié)腸以及糞便菌群變化的研究.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:探討急性肝衰竭小鼠腸道微生態(tài)菌群的變化,尋找特征性差異菌,為急性肝衰竭腸道微生態(tài)紊亂的診治提供依據(jù)。
  方法:BALB/c雄鼠30只(空白組5只,模型組25只),D-氨基半乳糖制造小鼠急性肝衰竭模型。提取小鼠下消化道不同節(jié)段(回腸、結(jié)腸)內(nèi)容物及糞便的微生物DNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,對(duì)16S V3-V4區(qū)進(jìn)行高通量測(cè)序,利用生物信息學(xué)分析技術(shù)對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行OTU聚類(lèi),物種注釋?zhuān)炼鄻有苑治觯琇EfSe(LDA Effect

2、Size)分析,尋找模型組特征性差異菌。
  結(jié)果:2組小鼠,共存活10只,其中模型組死亡率為80%。回腸、結(jié)腸內(nèi)容物及糞便共30個(gè)樣本,測(cè)序覆蓋深度>97%。α多樣性分析顯示急性肝衰竭小鼠回腸中細(xì)菌豐度增加(chao1指數(shù)105.7±18.4與149.3±55,P<0.01),多樣性增加(shannon指數(shù)2.5±0.1與2.8±0.8,P<0.05);結(jié)腸中細(xì)菌豐度減低(chao1指數(shù)285.4±46.1與276.98±46.

3、7,P<0.05)及多樣性增加(shannon指數(shù)4.9±0.3與5.65±0.39,P<0.01),糞便中細(xì)菌多樣性降低(shannon指數(shù)5.1±0.3與4.87±0.29,P<0.01),豐度(chao1指數(shù)270.1±53.7與250.2±54.4,P=0.067)無(wú)顯著差異。模型組腸道菌群與空白組相比小鼠腸道中檢測(cè)到10個(gè)菌門(mén),以厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)和變形菌門(mén)為主。模型組回腸中細(xì)菌門(mén)水平差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;結(jié)腸中擬桿菌門(mén)比例增加(

4、9.3%±7.9%與33.8%±18.2%,P=0.024<0.05),TM7菌門(mén)比例增加(0.2%±0.3%與2.2%±1.6%,P=0.029<0.05);糞便中厚壁菌門(mén)減少(32.8%±20.5%與10.2%±5.5%,P=0.05)、擬桿菌門(mén)增加(57.3%±23.4%與86.1%±67.2%,P=0.07),但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。在最佳分類(lèi)水平上,回腸梭菌科豐度減少(44.95%±19.28%與7.51%±16.57%,P<0.

5、05),結(jié)腸理研菌科(1.08%±1.01%與4.18%±2.39%,P<0.05)、S24-7(4.75%±4.87%與22.77%±13.05%,P<0.05)、F16(0.24%±0.28%與2.18%±1.61%,P<0.05)等豐度增加。LEfSe(LDA Effect Size)分析顯示兩組在葡萄球菌科、S24-7方面差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,其中S24-7可定義為特征性差異菌群。
  結(jié)論:不同節(jié)段腸道擁有不同的腸道菌群結(jié)構(gòu)

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