自然反義轉(zhuǎn)錄本調(diào)節(jié)CD45基因選擇性剪接.pdf_第1頁(yè)
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1、真核生物的多數(shù)pre-mRNA通過拼接選擇性外顯子產(chǎn)生不同的成熟mRNA亞型,這些mRNA剪接亞型可以翻譯具有不同生物學(xué)功能的蛋白亞型或者直接在RNA水平發(fā)揮調(diào)控作用。以往研究選擇性剪接多關(guān)注于RNA pol II、DNA結(jié)合蛋白以及相關(guān)剪接因子的調(diào)節(jié)作用。但是,近年來發(fā)現(xiàn)選擇性剪接也受表觀遺傳學(xué)修飾調(diào)節(jié),機(jī)制包括:染色質(zhì)重塑、組蛋白修飾以及DNA甲基化。自然反義轉(zhuǎn)錄本(natural antisense transcripts,NAT

2、s),是位于編碼基因反義鏈上的DNA序列產(chǎn)生的內(nèi)源性RNA。根據(jù)其與正義編碼基因的位置關(guān)系,分頭對(duì)頭(5’to5’)、尾對(duì)尾(3’to3’)、以及完全重疊(full overlap)三種方式。自然反義轉(zhuǎn)錄本與正義轉(zhuǎn)錄本反向互補(bǔ),可能在DNA修飾、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工、RNA的穩(wěn)定性與降解等多個(gè)層面發(fā)揮對(duì)正義基因的表達(dá)調(diào)控作用。
  白細(xì)胞共同抗原CD45(亦稱為PTPRC)是一種跨膜蛋白酪氨酸磷酸酶,特異表達(dá)于無核的血細(xì)胞中,具有激活

3、酪氨酸激酶去磷酸化活性,在細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中發(fā)揮作用。CD45基因可轉(zhuǎn)錄CD45 RA、CD45 RB、CD45 RC以及CD45 RO等多種剪接亞型,這些亞型標(biāo)志著淋巴細(xì)胞的不同功能狀態(tài),并與臨床一些免疫相關(guān)疾病的發(fā)病以及病情進(jìn)展相關(guān)。
  系統(tǒng)性紅斑狼瘡(Systemic lupus erythematosus,SLE)是一種自身免疫性相關(guān)的結(jié)締組織疾病,患者外周血中CD45 RA亞型明顯要低于正常人,且外周血中CD45 RA

4、/RO亞型可作為其疾病的特異標(biāo)記物。
  為研究反義轉(zhuǎn)錄本對(duì)正義基因CD45選擇性剪接的調(diào)控作用和作用機(jī)制,并探討其與臨床免疫疾病SLE的相關(guān)性,本研究:(a)PCR克隆CD45基因的自然反義轉(zhuǎn)錄本,并通過佛波酯(PMA)處理人白血病細(xì)胞株U937細(xì)胞,建立CD45剪接亞型差異性表達(dá)的細(xì)胞模型,并利用實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)CD45反義轉(zhuǎn)錄本與正義各亞型表達(dá)量之間的關(guān)系。(b)RNAi下調(diào)CD45反義轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)量,觀察反義轉(zhuǎn)錄本對(duì)正義

5、CD45剪接亞型表達(dá)量的影響。(c)U937細(xì)胞knockdown CD45反義轉(zhuǎn)錄本后,采用甲基化特異性PCR檢測(cè)CD45基因DNA的甲基化狀態(tài),以探索反義RNA對(duì)正義基因表觀遺傳學(xué)的修飾作用。(d)收集臨床SLE患者外周血標(biāo)本,提取RNA,經(jīng)實(shí)時(shí)定量PCR分析CD45反義轉(zhuǎn)錄本在臨床疾病中與正義CD45各種亞型表達(dá)量以及SLE發(fā)病及疾病進(jìn)展之間的關(guān)系。
  實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示CD45反義轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)量與CD45 RO亞型表達(dá)具有正相

6、關(guān)性,干擾CD45反義轉(zhuǎn)錄本可特異性降低CD45 RO亞型表達(dá),提示CD45反義轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)與正義CD45外顯子剪接跳讀存在相關(guān)性。同時(shí),甲基化特異性PCR結(jié)果顯示干擾CD45反義轉(zhuǎn)錄本可導(dǎo)致正義DNA序列的甲基化水平增加,提示反義RNA可能通過DNA甲基化在表觀遺傳學(xué)水平調(diào)控正義基因的選擇性剪接。PMA處理U937細(xì)胞可調(diào)節(jié)CD45基因選擇性剪接模式,促進(jìn)CD45 RO亞型表達(dá),并呈現(xiàn)CD45 RA\RO亞型轉(zhuǎn)變的現(xiàn)象。SLE患者外周

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