1、蛋白質(zhì)序列庫搜索方法為液相-串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用儀產(chǎn)生的高通量質(zhì)譜數(shù)據(jù)提供了快速的分析方式，使生物樣品中的蛋白質(zhì)可以得到快速定性定量分析。然而，該過程仍然存在很多問題。本論文初步研究了蛋白質(zhì)序列庫搜索算法及對搜索結(jié)果進(jìn)行分析的算法，并嘗試采用化學(xué)計(jì)量學(xué)方法對蛋白質(zhì)庫搜索結(jié)果進(jìn)行判別分析。 在第二章中，論文對當(dāng)前廣泛采用的蛋白質(zhì)序列庫，庫搜索算法及蛋白質(zhì)定性方法進(jìn)行了介紹。同時(shí)對由五種不同質(zhì)譜儀產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)的SEQUEST搜索結(jié)果，及

2、不同參數(shù)條件下的Mascot搜索結(jié)果進(jìn)行對比，發(fā)現(xiàn)在不同條件下得到的結(jié)果相差較大，并且在所有的結(jié)果中存在大量的錯(cuò)誤匹配。 為了對蛋白質(zhì)序列庫搜索結(jié)果進(jìn)行分析，并最大限度地消除錯(cuò)誤結(jié)果的影響，大量的分析算法被開發(fā)出來，論文在第三章中對這些算法進(jìn)行了介紹，并嘗試采用化學(xué)計(jì)量學(xué)中的模式識別方法對搜索結(jié)果進(jìn)行判別分析，認(rèn)為化學(xué)計(jì)量學(xué)方法可以明顯消除SEQUEST搜索結(jié)果中假陽性結(jié)果的影響。但對于Mascot搜索結(jié)果，這些方法無明顯提高