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![中國(guó)人群DNA雙鏈斷裂修復(fù)基因多態(tài)性與膠質(zhì)瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性研究.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/10/8/acd40baa-d6eb-4267-98c1-87c3361c2499/acd40baa-d6eb-4267-98c1-87c3361c24991.gif)
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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
(1)了解人口學(xué)特征、家族史、環(huán)境暴露、不良行為習(xí)慣等因素對(duì)神經(jīng)膠質(zhì)瘤發(fā)病的影響;
(2)了解非同源末端連接修復(fù)(NHEJ)途徑的幾個(gè)主要基因位點(diǎn):LIG4 rs3093737、LIG4rs3093739; XRCC4 rs13161662、XRCC4rs2731858、XRCC4rs7715771;XRCC5 rs828704、 XRCC5rs3770502、 XRCC5rs9288516;XRCC6rs6
2、519265、XRCC6 rs132793;XRCC7 rs10109984的等位基因及基因型在病例組及對(duì)照組之間的分布差異;
(3)分析調(diào)整人口學(xué)特征、家族史、環(huán)境暴露等因素后,LIG4 rs3093737、LIG4rs3093739;XRCC4 rs13161662、XRCC4rs2731858、XRCC4rs7715771;XRCC5 rs828704、XRCC5rs3770502、XRCC5rs9288516; XRC
3、C6 rs6519265、XRCC6 rs132793;XRCC7 rs10109984對(duì)神經(jīng)膠質(zhì)瘤易感性的影響;
(4)了解同源重組(HR)途徑的幾個(gè)主要基因位點(diǎn):XRCC3 rs3212092、XRCC3 rs861530、RAD54L rs1048771、NBS1 rs1805794的等位基因及基因型在病例組及對(duì)照組之間的分布差異;
(5)分析調(diào)整人口學(xué)特征、家族史、環(huán)境暴露等因素后,XRCC3 rs32120
4、92、XRCC3 rs861530、RAD54L rs1048771、NBS1rs1805794對(duì)膠質(zhì)瘤易感性的影響;
(6)對(duì)今后神經(jīng)膠質(zhì)瘤患者篩查與早診早治提供有價(jià)值的參考。
方法:
收集調(diào)查期間經(jīng)過(guò)神經(jīng)病理學(xué)檢查確診的腦膠質(zhì)瘤患者224例作為病例組研究對(duì)象;選擇無(wú)腫瘤病史、未接受過(guò)放化療、無(wú)神經(jīng)系統(tǒng)疾病史、與對(duì)照組無(wú)血緣關(guān)系的健康體檢者作為對(duì)照,對(duì)照組按照性別、年齡與病例組進(jìn)行頻數(shù)匹配,最終共納入20
5、0名調(diào)查對(duì)象對(duì)照組。采用自行設(shè)計(jì)的調(diào)查表收集入組患者的一般人口學(xué)特征,包括姓名、性別、年齡、職業(yè)、婚姻狀況、居住地、經(jīng)濟(jì)情況及醫(yī)療保障、家族史、吸煙、腌臘制品食用情況、X射線暴露史等信息。采用EDTA-Na2抗凝采血管收集入組調(diào)查對(duì)象外周靜脈血5ml,置于-20℃冰箱中保存待用,按照血液基因組提取試劑盒(DP319)操作步驟進(jìn)行血液樣本基因組的提取。基因多態(tài)性的檢測(cè)采用Taqman探針?lè)ㄟM(jìn)行, SNP位點(diǎn)的選擇依據(jù)為文獻(xiàn)中與腫瘤易感性有
6、關(guān)的位點(diǎn)或具有爭(zhēng)議的位點(diǎn)。采用25μl的PCR反應(yīng)體系,在實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀中進(jìn)行DNA擴(kuò)增。應(yīng)用Epidata3.0建立調(diào)查數(shù)據(jù)庫(kù),采用SPSS17.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
結(jié)果:
第一部分:(1)調(diào)查對(duì)象文化程度主要為小學(xué)及以下(96人,占42.86%),其次為初中(65人,占29.02%)、高中/中專(41人,占18.30%),大學(xué)/大專及以上者22人,占9.82%;城區(qū)居住者114人,占50.89%,農(nóng)村居住者1
7、10人,占49.11%;婚姻狀況為單身者33人,占14.73%,已婚/同居者比例較高,共165人(73.66%),離婚/喪偶者26人(11.61%);職業(yè)以農(nóng)民為主(92人,占41.07%),其次為工人(82人,占36.61%),干部21人(9.38%),其他職業(yè)者29人(12.95%)。病例組及對(duì)照組各項(xiàng)人口學(xué)特征差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
(2)病例組有癌癥家族史者占23.66%,對(duì)照組為14.00%,兩組比例差
8、異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=6.381,P<0.05)。
(3)Hardy-Weinberg平衡吻合度檢驗(yàn)結(jié)果顯示,本次研究NHEJ通路候選基因的SNPs位點(diǎn)各基因型的分布在對(duì)照組中均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡(P值分別為0.633、0.924、0.732、0.057、0.245、0.431、0.095、0.916、0.876、0.993、0.900),本次研究對(duì)象的基因型可以代表本地區(qū)中國(guó)漢族人群的基因頻率分布。<
9、br> (4)LIG4基因的rs3093739、XRCC4基因的rs13161662及rs2731858、XRCC5基因的rs9288516幾個(gè)位點(diǎn)等位基因頻率在兩組間分布具有差異(P<0.05),LIG4基因、XRCC4基因、XRCC5基因的其余入選位點(diǎn)以及XRCC6、XRCC7入選的全部位點(diǎn)等位基因頻率在兩組間分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
(5)LIG4基因的rs3093739、XRCC4基因的rs131616
10、62及rs2731858、XRCC5基因的rs828704、rs9288516幾個(gè)位點(diǎn)的基因型在兩組間分布具有差異(P<0.05),LIG4基因、XRCC4基因、XRCC5基因的其余入選位點(diǎn)以及XRCC6、XRCC7入選的全部位點(diǎn)基因型頻率在兩組間分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
第二部分:
(1)Hardy-Weinberg平衡吻合度檢驗(yàn)結(jié)果顯示,本次研究HR通路候選基因的SNPs位點(diǎn)各基因型的分布在對(duì)照組中
11、均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡(P值分別為0.214、0.268、0.651、0.057),本次研究對(duì)象的基因型可以代表本地區(qū)中國(guó)漢族人群的基因頻率分布。
(2)將病例組及對(duì)照組的等位基因頻率進(jìn)行比較,XRCC3基因的rs3212092、及rs861530、RAD54L基因的rs1048771幾個(gè)位點(diǎn)的等位基因頻率在兩組間分布具有差異(P<0.05),NBS1基因入選的位點(diǎn)等位基因頻率在兩組間分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(
12、P>0.05)。
(3)將病例組及對(duì)照組的基因型頻率分布進(jìn)行比較后發(fā)現(xiàn),XRCC3基因的rs3212092、及rs861530、RAD54L基因的rs1048771幾個(gè)位點(diǎn)的基因型在兩組間分布具有差異(P<0.05),NBS1基因入選的位點(diǎn)基因型頻率在兩組間分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
(4)應(yīng)用單因素非條件logistic回歸分析對(duì)本次HR通路候選基因位點(diǎn)對(duì)膠質(zhì)瘤易感性的影響進(jìn)行分析,結(jié)果顯示,XRCC3
13、 rs3212092 CT及TT基因型與CC基因型相比,能夠增加1.774倍的患病風(fēng)險(xiǎn)(OR95%C.I.=1.106-2.847)。
結(jié)論:
(1)本次研究候選基因的SNPs位點(diǎn)各基因型的分布在對(duì)照組中均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡,研究對(duì)象的基因型可以代表本地區(qū)中國(guó)漢族人群的基因頻率分布。
(2)病例組與對(duì)照組相關(guān)危險(xiǎn)因素分析結(jié)果中,癌癥家族史分布差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。飲酒、吸煙、喜好食用腌臘
14、制品、從事X射線暴露職業(yè)、從事化學(xué)品接觸職業(yè)在兩組調(diào)查對(duì)象中,分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
(3)本次納入的基因位點(diǎn)中,NHEJ通路的LIG4 rs3093739、XRCC4rs13161662、XRCC4 rs2731858及XRCC5 rs9288516的基因型頻率及等位基因頻率、XRCC5rs828704的基因型頻率在病例組及對(duì)照組間分布有差異;HR通路的XRCC3 rs3212092、XRCC3 rs861530、RAD5
15、4Lrs1048771的基因型頻率及等位基因頻率在病例組及對(duì)照組間分布有差異。
(4)單因素條件Logistic回歸分析顯示,NHEJ通路的LIG4 rs3093739、XRCC4 rs13161662、XRCC4 rs2731858及XRCC5rs9288516幾個(gè)位點(diǎn)與膠質(zhì)瘤的易感性有關(guān);HR通路的XRCC3 rs3212092、XRCC3 rs861530、RAD54Lrs1048771幾個(gè)位點(diǎn)與神經(jīng)膠質(zhì)瘤的易感性有關(guān)。
16、
(5)多因素條件Logistic回歸分析中,調(diào)整人口學(xué)特征及相關(guān)危險(xiǎn)因素后,NHEJ通路的LIG4 rs3093739(OR=1.556,OR95%C.I.=1.050-2.305)、XRCC4rs13161662(OR=0.505, OR95%C.I.=0.346-0.736)、XRCC5 rs828704(OR=0.698,OR95%C.I.=0.478-0.920)、XRCC5 rs9288516(OR=1.413,
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