1、目的：
　　了解廣州地區(qū)靜脈吸毒人群和男男同性性行為人群HIV-1基因亞型分布特征和進(jìn)化關(guān)系，尋找HIV-1的新亞型，探索各亞型可能的流行趨勢(shì);分析P6蛋白氨基酸變異特征及7個(gè)氨基酸缺失的流行分布，為艾滋病的治療與預(yù)防提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
　　方法：
　　收集來(lái)自廣東省皮膚病防治中心MSM(Men who have sex with men)和IDUs(Intravenous drug users)血液樣本182份，提取病毒

2、核酸，運(yùn)用巢式RT-PCR法擴(kuò)增HIV-1三個(gè)基因片段p17(670bp)，pol(840bp)，和gp41(461bp)。將擴(kuò)增產(chǎn)物純化后測(cè)序，構(gòu)建ML系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹，確定樣本基因亞型以及毒株之間的進(jìn)化關(guān)系。對(duì)所獲未知基因亞型URFs(unique recombinant forms)毒株進(jìn)行近全長(zhǎng)基因組序列擴(kuò)增，分析基因組結(jié)構(gòu)和進(jìn)化特征。擴(kuò)增CRF07BC亞型樣本gag全長(zhǎng)序列，將P6蛋白翻譯為氨基酸與HXB2比對(duì)，分析蛋白的缺失突

3、變，并結(jié)合數(shù)據(jù)庫(kù)中P6序列，分析p6△7(7-aa deletion)在不同人群，時(shí)間和地區(qū)的流行分布特征，構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
　　結(jié)果：
　　樣本人群中，HIV-1基因亞型以CRF01_AE，CRF07_BC和CRF08_BC為主，分別占32.4％，27.5％，17.6％。同時(shí)還存在CRF55_01B，B，C和CRF5901B等亞型以及6％的獨(dú)特重組株URF。IDU人群病毒基因亞型分布與MSM人群不同。MSM人群基因亞型以C

4、RF01AE和CRF07_BC為主，分別占45.5％和30.1％。而IDU人群主要為CRF08_BC(54.3％)和CRF07_BC(22.1％)。進(jìn)化分析顯示，廣州MSM人群中，CRF07_BC和CRF01_AE序列分別聚集為一或二個(gè)毒株簇，新疆，泰國(guó)，云南等地IDU和異性性行為人群序列位于外圍。IDU人群中，CRF07_BC序列變異較大，散在分布;CRF01_AE毒株與異性性行為人群聚集成簇，存在密切傳播關(guān)系。無(wú)論是MSM人群或ID

5、Us，兩個(gè)亞型毒株在各地區(qū)之間呈現(xiàn)交叉分布，沒有地域限制。CRF08_BC流行于IDU人群中，形成特有的廣州簇。在所有亞型中，env和gag的基因距離大于pol。同一基因不同亞型的進(jìn)化距離不同，subtypeB和CRF01_AE距離較大，CRF07_BC和CRF08_BC居中，CRF55_01B距離最小。研究得到一條來(lái)自MSM人群的近全長(zhǎng)基因組序列GD698，由CRF07_BC和CRF55_01B重組構(gòu)成，是一種新型的URF。與其他CR

6、F07_BC/CRF55_01B重組株相比，GD698兩個(gè)片段均來(lái)自MSM人群，有著獨(dú)特的重組斷點(diǎn)和鑲嵌結(jié)構(gòu)。另外，在296條HIV-1CRF07_BC亞型毒株中，54.1％的序列含有7個(gè)氨基酸的缺失(aa30-36，PIDKELY)。IDU人群p6△7流行率為37.3％，MSM人群為92.3％。IDU人群p6△7序列數(shù)量隨時(shí)間而增加。2002年以前約為27.3％，2003-2007年增長(zhǎng)為31.4％，到2013年流行率約為66.7％。

7、各地區(qū)流行情況也不一致，以南部較高(68.8％)，北部居中(41.2％)，西部最低(15.4％)。MSM人群則一直保持較高流行水平，不隨時(shí)間或地區(qū)變化。進(jìn)化分析顯示，MSM人群的p6△7毒株來(lái)自其他含p6△7的序列，隨病毒快速傳播，形成單一的毒株簇。而IDU人群p6△7序列起源于沒有缺失的毒株，呈散在分布。
　　結(jié)論：
　　廣州地區(qū)MSM和IDU人群HIV-1基因亞型分布呈現(xiàn)多樣性，兩人群的基因亞型有所不同，IDU人群主要流