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文檔簡介
1、一次微陣列實驗可同時觀測成千上萬基因的表達值,得到含有豐富生物信息的高維DNA微陣列基因表達數(shù)據(jù)。通過分析這些高通量數(shù)據(jù)中基因表達數(shù)據(jù)的關聯(lián)性,有助于研究未知基因的功能分類,推測基因間的相互作用關系,尋找共表達的基因類,預測基因的調控模式,根據(jù)基因間共調控或共表達關系構建基因相互作用關系網(wǎng)絡。
論文以基因芯片表達譜數(shù)據(jù)為數(shù)據(jù)源,采用統(tǒng)計學中的相關性理論,研究相關基因的相互作用關系,主要開展了以下工作:
1.對照轉錄因
2、子對基因的調控關系表,篩選出受轉錄因子調控的大腸桿菌操縱子,對篩選出的操縱子基因表達數(shù)據(jù)分別作皮爾遜相關性度量和斯皮爾曼秩相關性度量。研究結果表明,86.33%的操縱子內基因的皮爾遜相關系數(shù)在0.5-1之間分布,在p<0.01的水平上呈顯著性相關;84.53%的操縱子內基因的斯皮爾曼秩相關系數(shù)分布在0.5-1之間,在p<0.01的水平上呈顯著性相關。這些結果在高通量數(shù)據(jù)統(tǒng)計方面為操縱子預測提供了基因組信息,對操縱子的預測具有重要意義。<
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