深海熱液區(qū)非培養(yǎng)微生物基因資源的功能選及研究.pdf_第1頁(yè)
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1、深海熱液區(qū)具有高溫、高壓、劇烈化學(xué)梯度和pH梯度等特征,屬于地球上最極端的環(huán)境,其中蘊(yùn)含著豐富獨(dú)特的微生物資源。這些微生物在長(zhǎng)期的環(huán)境適應(yīng)過(guò)程中形成了自身獨(dú)特的代謝機(jī)制,可能產(chǎn)生一些比較特殊的次級(jí)代謝產(chǎn)物,非常有助于對(duì)海洋天然藥物和新穎生物活性分子的開(kāi)發(fā)利用。
   分子生態(tài)學(xué)研究發(fā)現(xiàn),絕大部分的海洋微生物是不可培養(yǎng)的,僅有極少數(shù)的微生物能夠被分離鑒定出來(lái)。采用宏基因組學(xué)技術(shù),能夠獲得自然環(huán)境中所有可培養(yǎng)微生物和不可培養(yǎng)微生物的

2、全部基因。它能夠克服純培養(yǎng)的局限性,有利于深海熱液區(qū)微生物基因資源的研究。
   本文對(duì)7個(gè)宏基因組文庫(kù)共計(jì)26600個(gè)克隆子進(jìn)行了抗細(xì)菌、抗真菌、抗腫瘤等活性篩選。
   以枯草芽孢桿菌和金黃色葡萄球菌作為指示細(xì)菌,采用雙層瓊脂平板法從Fosmid文庫(kù)4143-1中篩選到5個(gè)活性克隆,從Fosmid文庫(kù)5-35-17中篩選到7個(gè)活性克隆,從Fosmid文庫(kù)3-11-8中篩選到3個(gè)活性克隆,篩選活性克隆分別占它們各自文庫(kù)

3、克隆的0.0635%,0.153%,0.15%。
   以釀酒酵母和白色念珠菌作為指示真菌,采用濾紙片瓊脂擴(kuò)散法對(duì)上述15個(gè)活性克隆進(jìn)行抑菌實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)其中9個(gè)克隆子具有抗真菌活性。
   以HT1080和BEL7402腫瘤細(xì)胞系為篩選模型,采用CCK-8法對(duì)上述9個(gè)產(chǎn)色素活性克隆子進(jìn)行篩選,發(fā)現(xiàn)其中3個(gè)克隆子具有較好的細(xì)胞毒性。
   在對(duì)文庫(kù)進(jìn)行活性克隆篩選的過(guò)程中,意外地發(fā)現(xiàn)一些活性克隆子能夠產(chǎn)生色素。本文選

4、取了其中5個(gè)產(chǎn)色素較為穩(wěn)定的活性克隆子進(jìn)行轉(zhuǎn)座突變,結(jié)果發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座突變使編碼sigma54-依賴(lài)性轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子或苯酚羥化酶的功能基因失活后,會(huì)導(dǎo)致色素缺失現(xiàn)象。
   以金黃色葡萄球菌為指示菌,對(duì)活性克隆子25D7的色素缺失突變子進(jìn)行抑菌試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)色素缺失突變子的生物活性消失。在文庫(kù)克隆篩選中,色素可作為一個(gè)初步的篩選標(biāo)記,有利于快速判斷外源基因是否在宿主體內(nèi)獲得表達(dá)。
   此外,本文還對(duì)Fosmid文庫(kù)4143-1和C

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