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文檔簡介
1、人類基因組計劃已進入到后基因組時代,對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的研究和預測成為其主要的研究方向之一。由于通過實驗確定蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能速度較慢,而且會遇到一些目前無法解決的困難。因此探索利用理論及計算方法來從氨基酸序列快速地推斷出蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能具有重要意義。本文從氨基酸序列出發(fā),研究了同源寡聚蛋白質(zhì)分類,主要工作如下: 本文介紹了特征提取方法和同源寡聚蛋白質(zhì)分類的研究現(xiàn)狀,并對同源二聚體和同源非二聚體蛋白質(zhì)使用了基于偽氨基酸組成成分
2、特征提取和信息熵方法進行分類研究。偽氨基酸組成成分特征提取方法以傳統(tǒng)的氨基酸組成成分為基礎(chǔ),又考慮了不同層次殘基之間的相互影響,包含了蛋白質(zhì)序列的許多信息,根據(jù)這一特點,本文使用了偽氨基酸組成成分作為特征提取方法。FDOD方法是基于信息熵的信息離散性度量函數(shù),它和叉熵之間存在內(nèi)在的聯(lián)系,文中對它們之間的關(guān)系進行了研究,并在叉熵的基礎(chǔ)上對多分布偏差度量進行了進一步的思考。由于FDOD是叉熵的一種形式,因此在它的基礎(chǔ)上根據(jù)特征向量的提取情況
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