紫花苜蓿鹽誘導(dǎo)基因的篩選與克隆.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、土壤鹽漬化是影響農(nóng)作物產(chǎn)量和質(zhì)量的主要因素之一。植物抗鹽是一個由多基因控制的數(shù)量性狀,這決定了抗鹽機制的復(fù)雜性。雖然在植物耐鹽方面研究進(jìn)展迅速,但其具體分子生物學(xué)機制仍然不甚明了。本研究旨在通過分離和克隆與紫花苜蓿(Medicago sativa)鹽誘導(dǎo)表達(dá)相關(guān)基因,為揭示紫花苜蓿抗鹽分子機制、紫花苜蓿的耐鹽育種提供基礎(chǔ)。本研究取得的主要結(jié)果如下: 1、應(yīng)用SMRAT cDNA PCR技術(shù)擴(kuò)增了紫花苜蓿鹽脅迫和對照cDNA,產(chǎn)物

2、大部分彌散在0.7-2.0kb之間,并且有明顯的特征帶,這與大部分物種mRNA的真實大小與特征相符。擴(kuò)增后的cDNA進(jìn)行抑制性消減雜交,成功構(gòu)建了包含有810個克隆的紫花苜蓿鹽脅迫下生長與正常生長的差異表達(dá)cDNA文庫。隨機挑選12個克隆進(jìn)行PCR,結(jié)果表明插入片段主要分布在250~750bp之間,符合預(yù)期大小。 2、應(yīng)用反向Northern斑點雜交技術(shù)從消減cDNA文庫中高通量篩選得到119個陽性差異表達(dá)克隆,測序后得到110

3、條有效的EST序列,總共82個單獨EST序列其中包含有16個contigs和66個singlets。將82個EST序列遞交至GeneBank,獲得相對應(yīng)的接受號從FE896855到FE896936。 3、EST序列的BLASTn結(jié)果顯示在82個EST中45個的同源基因為已知功能,37個為未知功能,其中有4個未找到同源序列。統(tǒng)計顯示肌醇-1-磷酸合成酶,核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶,脂質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白,水通道蛋白,肌醇半乳糖苷合成酶,冷

4、誘導(dǎo)特異蛋白,脫水蛋白頻率最高;BLASTp結(jié)果顯示,所獲得的EST可以分為物質(zhì)和能量代謝、轉(zhuǎn)錄、蛋白命運、結(jié)合蛋白、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、機體防御與自救、發(fā)育、轉(zhuǎn)運、未分類、未知功能9類。 4、利用從文庫中篩選到的一個與大豆基因pGmPM10(accession No.AAA91965.1)同源的EST序列,進(jìn)行3′-RACE和5′-RACE,獲得一個cDNA全長序列為1728bp的基因,初步命名為MsLEA3-1(genebank ac

5、cession No.EU665182)。其最大開放閱讀框編碼一個含有436個氨基酸的蛋白,等電點為5.18,分子量為47.0KD。對MsLEA3-1蛋白氨基酸序列進(jìn)行同源比對分析表明,與大豆LEA蛋白pGmPM10同源性最高,E值為1e-108。 5、蛋白質(zhì)氨基酸序列分析表明:①氨基酸組成及含量與其他LEA蛋白非常接近,小分子量氨基酸和親水性氨基酸含量非常高,致使蛋白質(zhì)高度親水,半胱氨酸和色氨酸含量很低;②氨基酸序列中存在31

6、個11-mer重復(fù)序列,其一致序列為TKDYAGDAAEK,表明MsLEA3-1為第3組LEA蛋白;③MsLEA3-1蛋白與大豆的pGmPM10和pGmPM8蛋白11-mer重復(fù)序列組成與分布非常接近,而與第3組LEA蛋白的聊Type Ⅰ和聊TypeⅡ 11-mer重復(fù)的氨基酸分布有所不同,推測MsLEA3-1蛋白pGmPM10和pGmPM8一樣屬于新的第三組LEA蛋白類型;④在MsLEA3-1蛋白的N端有明顯的信號肽特征,C端有-ER

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