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文檔簡介
1、目的:
篩選出與CVB33C蛋白發(fā)生相互作用的人心臟細胞蛋白,并對陽性cDNA克隆進行分析和鑒定,為進一步探討CVB3的致病機制奠定基礎(chǔ)。
方法:
1、構(gòu)建pGBKT7-3C誘餌質(zhì)粒:提取CVB3感染的HeLa細胞的總mRNA,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,PCR擴增3C基因片段,用EcoR I和BamH I雙酶切后,克隆于載體pGBKT7中,酶切鑒定進行DNA測序驗證;
2、檢測誘餌質(zhì)粒pGBKT7-3C在
2、AH109酵母菌中表達與對報告基因的自激活:驗證AH109表型,將誘餌質(zhì)粒pGBKT7-3C用乙酸鋰法轉(zhuǎn)化至AH109中,挑取含pGBKT7-3C重組質(zhì)粒的陽性克隆接種選擇性培養(yǎng)平板,進行表型的鑒定,PCR驗證陽性酵母菌,Western Blot方法檢測融合蛋白表達,最后檢測DNA-BD-c-Myc-3C融合蛋白對報告基因的轉(zhuǎn)錄自激活;
3、從人心臟cDNA文庫中篩選與CVB3-3C蛋白有相互作用的陽性候選克隆:采用大規(guī)模酵母
3、配合法,將誘餌菌AH109[pGBKT7-3C]和人心臟cDNA文庫的培養(yǎng)物Y187[pGADT7-cDNA Library]相互配合,配合后接種于 SD/-Trp/-Leu/-His/-Ade平板,30℃倒置培養(yǎng)21d,篩選表達報告基因HIS3和ADE2的克隆;
4、陽性克隆的驗證和分析:將陽性克隆再轉(zhuǎn)種于SD/–Ade/–His/–Leu/–Trp/X-a-Gal平板,確保陽性克隆表型正確(能同時表達3種報告基因:HIS3
4、、ADE2和MEL1);將pGADT7-ADx質(zhì)粒電擊轉(zhuǎn)化至大腸桿菌,擴增后提取質(zhì)粒送測序。測序結(jié)果的同源性分析通過NCBI網(wǎng)站的BLAST程序比對完成(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi)。
結(jié)果:
1、成功構(gòu)建pGBKT7-3C誘餌質(zhì)粒,經(jīng)限制性內(nèi)切酶酶切和測序序列分析表明3C巳成功插入pGBKT7載體的多克隆位點,其基因序列與CVB3m株(GI:323432)
5、3C基因序列完全一致;
2、表型鑒定和PCR法均證實pGBKT7-3C質(zhì)粒成功轉(zhuǎn)入酵母菌,Western blot證實AHl09能表達3C蛋白;缺陷型培養(yǎng)基和酶底物X-α-Gal反應(yīng)結(jié)果顯示3C蛋白對報告基因無轉(zhuǎn)錄自激活作用;
3、以CVB33C為誘餌蛋白,從人心臟cDNA文庫中篩選到18個陽性候選克隆;
4、18個陽性候選克隆表型均正確(能同時表達3種報告基因:HIS3、ADE2和MEL1);經(jīng)測序和同源
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