AT陰離子堿基對中的質(zhì)子轉(zhuǎn)移機(jī)理研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文基于第一性原理的密度泛函理論(DFT),采用B3LYP/DZP++的方法,應(yīng)用Gaussian03程序計算了氣相下AT陰離子堿基對(AT)的質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程。我們分別對兩種單質(zhì)子轉(zhuǎn)移途徑進(jìn)行了計算,只得到了從胸腺嘧啶到腺嘌呤方向上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移(SPT1);對于雙質(zhì)子轉(zhuǎn)移,采用了協(xié)同雙質(zhì)子轉(zhuǎn)移機(jī)理和分步的雙質(zhì)子轉(zhuǎn)移機(jī)理進(jìn)行了計算,但均沒得到其過渡態(tài)和產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)。添加溶劑化效應(yīng)后,并沒有改變質(zhì)子轉(zhuǎn)移反應(yīng)的穩(wěn)定趨勢,在氣相中質(zhì)子轉(zhuǎn)移前的結(jié)構(gòu)較

2、質(zhì)子轉(zhuǎn)移后穩(wěn)定,在溶劑中保持相同趨勢。
  采用B3LYP/DZP++的方法計算了金屬Cu2+對AT陰離子堿基對的質(zhì)子轉(zhuǎn)移的影響。研究的結(jié)果表明:氣相條件下,金屬Cu2+的絡(luò)合作用對AT陰離子堿基對質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程影響顯著,Cu2+的絡(luò)合作用在胸腺嘧啶的O24和O28位時可以發(fā)生從胸腺嘧啶到腺嘌呤方向上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程(SPT1);作用在腺嘌呤的N4和N13位時可以發(fā)生分子間的雙質(zhì)子轉(zhuǎn)移(DPT)。添加溶劑化效應(yīng)后,比較四種絡(luò)合物在氣

3、相和溶液中質(zhì)子轉(zhuǎn)移的反應(yīng)能壘,得到溶劑化效應(yīng)對單質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程中的反應(yīng)能壘影響較小,對雙質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程中的反應(yīng)能壘影響較大。
  分別討論了一個和兩個水分子對(AT)堿基對質(zhì)子轉(zhuǎn)移的影響。在O24位加入一個H2O,只得到了SPT1方向上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移;在O28位加入一個H2O,可以發(fā)生SPT1方向上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移和分子間的雙質(zhì)子轉(zhuǎn)移;分別在腺嘌呤的N4和N13位加入一個H2O時,可以發(fā)生SPT1方向上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移以及從腺嘌呤到胸腺嘧啶方向

4、上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程(SPT2);當(dāng)兩個水分子加在O24、O28附近,計算得到了SPT1方向上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程和分子間的雙質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程(DPT);分別在N4、N13位和O28、N13加入兩個H2O,均得到了SPT1和SPT2兩種方向上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移,分子間的雙質(zhì)子轉(zhuǎn)移沒有發(fā)生;當(dāng)在O24和N4位附近加入兩個H2O后,只得到了SPT1方向上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移,SPT2方向上的單質(zhì)子轉(zhuǎn)移和分子間的雙質(zhì)子轉(zhuǎn)移(DPT)均沒有發(fā)生。
  在(AT)

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