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文檔簡介
1、生命本質(zhì)的科學(xué)研究和逐步探索對(duì)傳統(tǒng)分析提出了新的要求,利用傳統(tǒng)的分子群體檢測(cè)技術(shù)難以對(duì)復(fù)雜的生物學(xué)反應(yīng)做出解釋。單分子檢測(cè)(SMD)則可以對(duì)體系中的單個(gè)分子進(jìn)行研究,通過分析其物理量隨時(shí)間的變化關(guān)系,獲得單個(gè)分子特性、分布狀態(tài)以及特定變化的過程等。單分子檢測(cè)已經(jīng)成為生物物理學(xué)、分子生物學(xué)、物理化學(xué)、生物醫(yī)學(xué)以及納米材料與科學(xué)等許多科研領(lǐng)域的重要手段。目前,單分子熒光光譜技術(shù)已被廣泛的應(yīng)用于觀察核酸和蛋白質(zhì)等大分子的動(dòng)態(tài)相互作用、跟蹤單個(gè)
2、粒子的微納米級(jí)位移以及識(shí)別多亞基體系的旋轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng)等動(dòng)態(tài)過程,結(jié)合熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)技術(shù)則可以用來研究生物分子動(dòng)力學(xué)構(gòu)象變化和相互作用的動(dòng)力學(xué)過程。
蛋白-蛋白相互作用的研究對(duì)于揭示細(xì)胞的功能調(diào)控機(jī)制及疾病治療等方面具有重要的科學(xué)意義。但蛋白識(shí)別和分離過程中的構(gòu)象變化多發(fā)生在秒、毫秒甚至微秒時(shí)域,且表現(xiàn)為時(shí)間和空間上的動(dòng)態(tài)學(xué)不均勻性。本論文以自行搭建的單分子雙通道全內(nèi)反射熒光顯微(TIRFM)為主要研究手段、以植物谷胱甘
3、肽過氧化物酶(GPX)和硫氧還蛋白(TRX)為研究體系,實(shí)時(shí)研究GPX和TRX的相互作用以及蛋白構(gòu)象動(dòng)力學(xué)在其中的調(diào)控功能。具體工作如下:
1.單分子熒光動(dòng)力學(xué)測(cè)試系統(tǒng)的搭建:根據(jù)論文的工作設(shè)計(jì)和安排,我們自行設(shè)計(jì)并搭建了雙通道全內(nèi)反射熒光顯微鏡系統(tǒng),使其同時(shí)具有單分子FRET和單分子跟蹤及動(dòng)力學(xué)分析的功能。論文詳細(xì)介紹了該裝置的搭建思路和過程,包括各個(gè)儀器配件的選擇和調(diào)試;通過對(duì)雙熒光標(biāo)記 DNA的測(cè)試分析和檢驗(yàn),實(shí)現(xiàn)了整個(gè)
4、系統(tǒng)的性能優(yōu)化,為之后在單分子水平上研究蛋白相互作用的動(dòng)力學(xué)過程打下了基礎(chǔ)。
2.擬南芥谷胱甘肽過氧化物酶(AtGPX3)和硫氧還蛋白(AtTRX9)的相互作用研究:我們利用已經(jīng)搭建的 TIRFM系統(tǒng),結(jié)合單分子熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù),以擬南芥谷胱甘肽過氧化物酶(AtGPX3)和硫氧還蛋白(AtTRX9)為研究體系,對(duì)AtGPX3和AtTRX9之間的蛋白相互作用過程進(jìn)行了研究。在體相上,通過熒光標(biāo)記蛋白和熒光光譜技術(shù),觀測(cè)到了兩
5、種作用蛋白之間存在明顯的FRET現(xiàn)象,證實(shí)了AtGPX3和AtTRX9之間存在相互作用。在單分子水平上,利用 TIRFM系統(tǒng)對(duì)標(biāo)記后的AtGPX3和AtTRX9相互作用過程中供體和受體的強(qiáng)度變化進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè),并將計(jì)算所得的smFRET效率進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在兩種蛋白進(jìn)行電子交換之后,二者之間的FRET效率呈現(xiàn)三種分布,特別是FRET效率從最高到最低之間存在一個(gè)明顯的中間態(tài);該中間態(tài)主要有兩種不同的效率值,0.8和0.4,分別對(duì)應(yīng)于
6、兩個(gè)蛋白分離過程中的兩種不同空間距離;而 FRET的非零最小值表明AtGPX3和AtTRX9蛋白相互作用后并沒有完全分離。通過對(duì)兩種作用蛋白的氨基酸序列及晶體結(jié)構(gòu)分析,認(rèn)為在兩蛋白相互作用的過程中可能存在兩種電子轉(zhuǎn)移方式以及二硫鍵的形成模式。
總之,本論文工作包括自行搭建了TIRFM系統(tǒng),并利用單分子熒光技術(shù)對(duì)AtGPX3和AtTRX9之間的相互作用過程進(jìn)行了實(shí)時(shí)的觀測(cè)和研究,獲得了AtGPX3和AtTRX9分離過程中蛋白構(gòu)象
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