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![馬鈴薯試管薯形成相關(guān)的光糖同時響應(yīng)基因及耐熱基因型篩選.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/11/8/eecef584-1192-45a2-8df5-49706b3c95b5/eecef584-1192-45a2-8df5-49706b3c95b51.gif)
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文檔簡介
1、隨著植物組織培養(yǎng)技術(shù)的不斷成熟,組織培養(yǎng)條件下通過控制培養(yǎng)基成分和培養(yǎng)條件,可以誘導(dǎo)腋芽形成試管薯(microtuber)。研究表明馬鈴薯試管薯在組織結(jié)構(gòu)、生長發(fā)育、遺傳穩(wěn)定性等方面與自然狀態(tài)下的塊莖基本相同,這為試管薯在生產(chǎn)和研究上的應(yīng)用提供了最基本的前提。試管薯的形成條件的研究有很多,其中較為明確的結(jié)果是短日照和較高的蔗糖濃度是試管薯形成的必須條件,但關(guān)于光周期與蔗糖的協(xié)同調(diào)控試管薯形成機制目前還不清楚。馬鈴薯是喜涼作物,溫度是影響
2、馬鈴薯產(chǎn)量最重要的因素之一,高溫會抑制塊莖的形成,對于一些熱帶地區(qū)而言,馬鈴薯種植仍然存在許多困難,而馬鈴薯耐熱機制和遺傳基礎(chǔ)研究的還十分缺乏。
基于上述背景本研究主要分為兩大部分內(nèi)容,第一部分在實驗室前期利用RNA-seq技術(shù)分別建立的光周期和蔗糖轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫的基礎(chǔ)上,對其進(jìn)行進(jìn)一步分析,篩選光-糖協(xié)同作用的差異表達(dá)基因,為深入研究光糖協(xié)同調(diào)控馬鈴薯試管薯形成的分子機理提供研究基礎(chǔ)。第二部分是利用實驗室試管薯研究平臺,在前期
3、光周期對試管薯生長發(fā)育影響研究的基礎(chǔ)上,先確定耐熱性篩選鑒定的溫度,然后通過耐熱性鑒定篩選出耐熱性差異基因型,為后期進(jìn)一步分離出耐熱性差異的相關(guān)基因奠定基礎(chǔ)。研究結(jié)果如下:
1.光糖同時響應(yīng)的相關(guān)基因篩選:首先通過對前期利用第一代RNA-seq測序技術(shù)獲得的光周期處理轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)資料進(jìn)行重分析,在將其與現(xiàn)在的馬鈴薯基因組數(shù)據(jù)庫序列比對的基礎(chǔ)上,使基因標(biāo)簽與現(xiàn)在馬鈴薯的通用基因標(biāo)簽一致。然后按照現(xiàn)在的分析方法重新分析,篩選得到17
4、0個光周期響應(yīng)的差異表達(dá)基因。其次,利用實驗室前期已有的蔗糖處理轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)資料,采用相同的分析方法得到響應(yīng)蔗糖的差異表達(dá)基因302個,比對分析篩選到128個光糖同時響應(yīng)基因。
2.光糖同時響應(yīng)的相關(guān)基因的信息分析:對光周期和蔗糖同時有響應(yīng)的128個基因進(jìn)行GO(Gene Ontology)注釋和KEGG pathway路徑分析,發(fā)現(xiàn)基因涉及了37個功能小類和28條代謝路徑上。其中主要涉及了光合作用、植物病原互作和激素信號傳
5、導(dǎo)等路徑。
3.光糖同時響應(yīng)的關(guān)鍵基因確定與表達(dá)分析:結(jié)合GO和KEGG pathway注釋,選擇了26個涉及脅迫應(yīng)答、糖類代謝、發(fā)育、激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)以及若干功能未知基因進(jìn)行進(jìn)一步的分析,選其中的7個基因?qū)ζ湓诮Y(jié)薯表型顯著差異基因型中的表達(dá)模式進(jìn)行比較分析,發(fā)現(xiàn)有3個基因?qū)Y(jié)薯響應(yīng),分別是PGSC0003DMT400007869(Osmotin)PGSC0003DMT400013500(Glucose-6-phosphate/p
6、hosphatetranslocator2)和PGSC0003DMT400073694(Chloroplast-post-illumination-chlorophyll fluorescence increase protein)。
4.馬鈴薯高溫處理溫度確定:先以馬鈴薯結(jié)薯季節(jié)可能的較高溫度范圍(26-30℃)為耐熱性篩選溫度設(shè)置范圍,26℃處理不能達(dá)到篩選鑒定耐熱基因型的目的,而30℃高溫處理下的試管苗幾乎都無法正常生長
7、,介于其中的28℃培養(yǎng)條件下可以明顯反應(yīng)基因型對溫度的敏感程度,所以確定以28℃作為篩選鑒定馬鈴薯耐高溫性的實驗溫度。
5.馬鈴薯耐熱性差異基因型篩選:為篩選耐熱性差異基因型,用MTI群體材料中的9個基因型在恒溫(28℃)處理基礎(chǔ)上又做了晝夜變溫(日間28℃夜間25℃)處理,并對照實驗室對這些基因型在長日照和短日照條件下的結(jié)薯習(xí)性評價,最終篩選得到光溫雙敏感基因型MTI115和MTI035,光周期不敏感但溫度敏感的基因型MTI
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