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1、本論文采用密度泛函理論(DFT)研究了羥基自由基(?OH)引發(fā)的尿嘧啶核苷的氧化損傷機(jī)理,主要內(nèi)容包括:
1.?OH與尿嘧啶核苷反應(yīng)機(jī)理和動(dòng)力學(xué)研究
采用量子化學(xué)DFT方法研究了?OH與尿嘧啶核苷發(fā)生加成反應(yīng)和脫氫反應(yīng)的機(jī)理,以水和苯代表極性和非極性溶劑,探究了溶劑化效應(yīng)對(duì)反應(yīng)的影響。采用變分過渡態(tài)CVT理論/小曲率隧道效應(yīng)SCT方法計(jì)算了氣相、水相及苯相中,298K和人體正常溫度310K下各反應(yīng)路徑的速率常數(shù),給出
2、了反應(yīng)的分支比,確定了主要反應(yīng)通道。
?OH可以和尿嘧啶核苷發(fā)生加成反應(yīng)和脫氫反應(yīng),形成四條加成反應(yīng)通道和三條脫氫反應(yīng)通道。加成反應(yīng)是主要反應(yīng),占總反應(yīng)的99.9%,而脫氫反應(yīng)幾乎可以忽略。cis-U6OH加合物在熱力學(xué)上是最穩(wěn)定的產(chǎn)物,而cis-U5OH路徑的反應(yīng)能壘最低,由于動(dòng)力學(xué)因素占主導(dǎo)地位,所以cis-U5OH是最主要的反應(yīng)路徑,cis-U5OH加合物是最主要的產(chǎn)物,在298K和310K下三相中分支比為59.0%-7
3、1.6%。在極性溶劑水中所有反應(yīng)路徑的能壘都升高,而在非極性溶劑苯中所有反應(yīng)路徑的能壘都下降,但反應(yīng)趨勢(shì)不變,在所有環(huán)境中,反應(yīng)的順序都為cis-U5OH>trans-U5OH>trans-U6OH>cis-U6OH>UN3H8>UC5H10>UC6H11。298K時(shí),氣相、水相和苯相中的總反應(yīng)速率常數(shù)分別為2.39×1010、2.74×109和8.01×1010dm-3 mol-1 s-1,和實(shí)驗(yàn)值能很好吻合。
2.5(6)
4、-羥基-6(5)-過氧基-5,6-二氫尿嘧啶核苷異構(gòu)化反應(yīng)機(jī)理研究
?OH與尿嘧啶核苷發(fā)生加成反應(yīng)生成的四種加成產(chǎn)物容易和O2反應(yīng),生成5-羥基-6-過氧基-5,6-二氫尿嘧啶核苷和5-過氧基-6-羥基-5,6-二氫尿嘧啶核苷,共八種構(gòu)型。采用量子化學(xué)方法在B3LYP/6-311+G(d,p)水平下研究了這八種尿嘧啶核苷過氧自由基異構(gòu)化反應(yīng)路徑,確定了各過氧自由基的主要反應(yīng)路徑。
反應(yīng)路徑主要有三種,A路徑:順式(c
5、is)的四種構(gòu)型發(fā)生C5-C6開環(huán)反應(yīng),生成二醛基化合物;B路徑:反式(trans)的四種構(gòu)型發(fā)生成環(huán)反應(yīng),生成環(huán)氧化合物;C路徑:5-過氧基-6-羥基-5,6-二氫尿嘧啶核苷(5-OO-6-OH-DHU)的四種構(gòu)型還可能發(fā)生N1-C6開環(huán)反應(yīng)。A和C路徑會(huì)導(dǎo)致堿基開環(huán),而B路徑則導(dǎo)致成環(huán),其中C路徑反應(yīng)能壘最高。
研究了單分子水對(duì)異構(gòu)化反應(yīng)的影響。水分子的加入影響了氫轉(zhuǎn)移過程的能量,使A和B路徑的能壘升高,而C路徑的能壘下降
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