基于核酸擴(kuò)增與雜交的口蹄疫病毒分型檢測方法研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、口蹄疫是一類急性、烈性的傳染病,其早期診斷及分型診斷不僅是疫情防控的關(guān)鍵,也是疫情發(fā)生時食品安全監(jiān)管的一項重要內(nèi)容。環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)可以在恒溫條件下實現(xiàn)快速、高效、靈敏的核酸檢測,近年來多種肉眼可視以及儀器分析的檢測方法的應(yīng)用,使得該方法更加符合現(xiàn)場快速檢測的需求。反向斑點雜交技術(shù)可以同時進(jìn)行多個靶基因的并行檢測,在口蹄疫病毒的分型檢測中具有極大的優(yōu)勢,尤其是近年來隨著基因芯片技術(shù)的不斷發(fā)展,簡化了操作程序,縮短了檢測時間,符合口蹄疫

2、病毒高通量檢測的需求。本論文以環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)和反向斑點雜交技術(shù)為基礎(chǔ),建立了兩種口蹄疫病毒的分型檢測方法,以滿足現(xiàn)場快速檢測的需要,為口蹄疫病毒的防控提供簡便、快速的技術(shù)保障,論文的主要內(nèi)容及結(jié)果如下:
   (1)篩選用于口蹄疫病毒分型檢測的環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增引物。針對七種血清型口蹄疫病毒序列差別較大的VP1片段,設(shè)計并合成具有血清型特異性的環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增引物。每組引物按照內(nèi)引物與外引物8∶1、內(nèi)引物與環(huán)引物2∶1的摩爾濃度比

3、配制成引物溶液,分別擴(kuò)增七種血清型口蹄疫病毒的重組質(zhì)粒,均僅有對應(yīng)血清型的模板出現(xiàn)陽性結(jié)果,具有良好的血清型特異性。
   (2)建立口蹄疫病毒的環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增分型檢測方法。利用環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增實時熒光檢測系統(tǒng)和實時濁度檢測系統(tǒng),實時監(jiān)測擴(kuò)增過程中的信號變化,可以對O型、AsiaI型、A型、C型、SAT1型、SAT2型、SAT3型七種血清型口蹄疫病毒的重組質(zhì)粒和O型、AsiaI型、A型口蹄疫病毒的乳鼠傳代病毒進(jìn)行分型檢測。比較兩種

4、實時檢測系統(tǒng)對七種血清型口蹄疫病毒重組質(zhì)粒的檢測靈敏度,實時熒光檢測系統(tǒng)在20min內(nèi)即可檢測到1-100fg/μL的模板,用時和靈敏度均優(yōu)于傳統(tǒng)方法,而實時濁度檢測系統(tǒng)在30min內(nèi)可檢測到1-100pg/μL的模板,其靈敏度與傳統(tǒng)檢測方法相當(dāng),但用時大大縮短。
   (3)建立口蹄疫病毒的室溫反向斑點雜交分型檢測方法。針對七種血清型口蹄疫病毒序列差別較大的VP1片段,設(shè)計并合成通用性擴(kuò)增引物和特異性寡核苷酸探針。以O(shè)型、As

5、iaI型、A型、C型、SAT1型、SAT2型、SAT3型七種血清型口蹄疫病毒的重組質(zhì)粒和O型、AsiaI型、A型口蹄疫病毒的乳鼠傳代病毒為模板,制備生物素標(biāo)記的目的片段,與固定在帶正電荷的尼龍膜上的特異性寡核苷酸探針進(jìn)行室溫雜交,雜交特異性好,且無交叉反應(yīng)。
   (4)口蹄疫病毒室溫反向斑點雜交分型檢測方法的優(yōu)化。當(dāng)探針濃度為100μmol/L,甲酰胺用量為5mL(20mL反應(yīng)體系),雜交時間為60min,酶促反應(yīng)時間為30m

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