1、代謝網(wǎng)絡(luò)是研究生物代謝特性的一個(gè)強(qiáng)大的工具，基因組尺度代謝網(wǎng)絡(luò)模型的構(gòu)建及其模擬在提供系統(tǒng)代謝工程策略方面發(fā)揮著越來越重要的作用。目前已經(jīng)有許多方法用于研究代謝網(wǎng)絡(luò)，而通量平衡分析是最常用的量化研究生物信息學(xué)中基因組規(guī)模代謝網(wǎng)絡(luò)的方法,它利用數(shù)學(xué)上的最優(yōu)化理論解決生物問題，求解最優(yōu)目標(biāo)函數(shù)值以及通量分布，通常情況下是某個(gè)反應(yīng)的最大反應(yīng)速率以及在此條件下其余反應(yīng)的速率。
　　目前已經(jīng)發(fā)表了一些應(yīng)用通量平衡分析的工具，我們對這些工具進(jìn)

2、行了分析比較，發(fā)現(xiàn)這些工具在應(yīng)用方面仍然存在一些缺陷，并取長補(bǔ)短構(gòu)建了一個(gè)新的、開放的、用戶友好的代謝網(wǎng)絡(luò)通量平衡分析工具包。這個(gè)工具包包含基本的表型預(yù)測功能如預(yù)測菌體的生長速度、魯棒性分析、表型相平面分析等，還可以自動化查找代謝網(wǎng)絡(luò)模型中的末端代謝物以及不能合成的前體代謝物。另外，我們還提出了一種新的基于通量平衡分析的查找和填補(bǔ)網(wǎng)絡(luò)缺口的方法，并將其應(yīng)用在本工具包中，能夠從一個(gè)代謝反應(yīng)列表中找出一個(gè)或若干個(gè)反應(yīng)填補(bǔ)模型中的缺口。然后利