AVM和IVM與GABA受體分子對接研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、阿維菌素(avermectin,AVM)由于其具有高效、低毒和無殘留等特點,順應了低碳生活,綠色化學的潮流而迅速被人們認可,從而得到大面積的推廣??墒请S著阿維菌素應用時間延長,昆蟲對AVM產(chǎn)生了抗性,導致藥效越來越差。這就給科學家提出了要不斷對該產(chǎn)品推陳出新的要求,但是目前在分子水平研究阿維菌素的殺蟲機理的研究較少?;诖?,本課題組首先選擇乙酰膽堿受體(1OED)模型作為模板使用ORCHESTRAR軟件根據(jù)同源模擬的方法構(gòu)建家蠅GABA

2、受體,果蠅RDL受體及果蠅復合蛋白受體三種蛋白及其突變受體。使用多種蛋白評價手段檢測得出構(gòu)建的結(jié)構(gòu)的合理性,拉氏圖檢測結(jié)果顯示所得模型中處于合理區(qū)域和可以接受的合理區(qū)域的氨基酸殘基的比例遠高于90%的標準,這說明本次同源模擬得到的蛋白結(jié)構(gòu)模型是合理的。
  根據(jù)相關(guān)文獻確定AVM在家蠅及果蠅GABA受體蛋白的結(jié)合位點,即位于穿膜區(qū)域兩個亞組之間的位置并與胞外區(qū)域靠近。最后使用Surflex-Dock軟件將AVM/IVM分子分別對接

3、到突變前后的GABA受體蛋白。結(jié)果顯示AVM/IVM分子與昆蟲GABA受體(家蠅GABA受體、果蠅RDL受體和果蠅復合受體)的結(jié)合自由能分別為-7.84 Kcal/moL和-4.75 Kcal/moL表明昆蟲GABA受體與AVM與的結(jié)合強度明顯高于IVM,這一結(jié)果與AVM毒性高于IVM相吻合。突變以后昆蟲GABA受體與AVM/IVM的結(jié)合自由能升高了0.31~3.59 Kcal/moL,這與昆蟲基因突變導致其對AVM藥物產(chǎn)生抗性相吻合。

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