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文檔簡介
1、長非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是指一類含有200個核苷酸以上,但不能編碼蛋白質的RNA分子。研究發(fā)現(xiàn),lncRNA普遍存在哺乳動物細胞中,通過表觀遺傳學調控、基因轉錄調節(jié)以及影響細胞核亞結構的形成等多種方式參與眾多細胞生理功能的調節(jié)。lncRNA來源廣泛,它們可以轉錄自基因間區(qū)域、基因的上游區(qū)域、基因內區(qū)域或與蛋白編碼基因形成自然反義轉錄本。據不完全統(tǒng)計,目前發(fā)現(xiàn)人類約有10,000-15,000種
2、lncRNA,而僅有大約100種lncRNA的功能得到驗證,還有大量lncRNA的功能尚待進一步探究。
輔酶Ⅱ依賴性視黃醛脫氫還原酶(NADP(H)-dependent retinol dehydrogenase/reductase, NRDR)是全反式維甲酸合成代謝的關鍵酶,由DHRS4基因編碼。人DHRS4基因及其下游兩個同源基因DHRS4L2和DHRS4L1共同組成DHRS4基因簇,三者串聯(lián)排列于人類染色體14q11.2
3、位點。另外,在DHRS4基因反義鏈存在DHRS4-AS1(C14orf167)基因,其轉錄生成的lncRNA與DHRS4基因以頭對頭方式形成自然反義轉錄本(natural antisense transcripts,NATs),并對DHRS4基因簇的表達具有調控作用。
運用RACE技術,我們在人睪丸細胞株和人正常肝細胞株HL7702中,分別克隆得到了序列完全相同的DHRS4-AS1轉錄本亞型——ASDHRS4-1。在人睪丸細胞
4、株中,利用siRNA干擾沉默ASDHRS4-1后,運用實時定量PCR檢測DHRS4 mRNA水平沒有變化,但運用western blotting技術檢測 NRDR蛋白水平下降,提示自然反義轉錄本ASDHRS4-1在翻譯水平調控DHRS4基因表達。為進一步研究ASDHRS4-1對DHRS4基因調控的分子機制,我們對ASDHRS4-1進行序列分析后發(fā)現(xiàn),其序列中存在反轉錄轉座子 LTR7C和AluSq以及與DHRS4基因的重疊區(qū)域——OL(
5、Overlap)序列。針對以上發(fā)現(xiàn)我們構建了一系列由 LTR7C、AluSq和OL序列特定組合的反義質粒,檢測不同反義序列對DHRS4表達的影響。結果發(fā)現(xiàn):在HL7702細胞株中,轉染ASDHRS4-1全長質粒后,實時定量PCR結果顯示DHRS4 mRNA水平同樣沒有變化,但western blotting結果顯示NRDR蛋白水平下降,而轉染其他質粒蛋白質和mRNA水平均無明顯變化。
基于以上的研究發(fā)現(xiàn),我們認為:1、ASDH
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