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1、雞蛋清溶菌酶(HEWL)是一種水溶性好且內(nèi)部結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的蛋白酶,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明它對(duì)碳納米管(CNTs)有較好的分散作用。本分運(yùn)用分子動(dòng)力學(xué)的方法模擬了水溶液中HEWL在碳納米管表面的吸附行為。選取了HEWL中暴露在外表面的六個(gè)疏水位點(diǎn)正對(duì)碳納米管在300K的溫度條件下分別進(jìn)行了50納秒的計(jì)算機(jī)模擬。在所選取的六個(gè)取向中都發(fā)生了吸附,在吸附過程中HEWL面向碳納米管的氨基酸殘基會(huì)向更為柔性的結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)變,以增大蛋白質(zhì)在碳納米管表面的覆蓋率。在50
2、納秒的模擬時(shí)間內(nèi),HEWL和碳納米管間的相互作用能隨時(shí)間的延長(zhǎng)而增加,但這種能量遞增是呈階段性而非線性的。這表明HEWL在CNTs表面的吸附是逐步進(jìn)行的,在跨越一定的能量障礙后HEWL中的部分殘基才會(huì)漸漸向CNTs移近,最后達(dá)到吸附平衡。從模擬結(jié)果來看,由初始吸附到到達(dá)吸附平衡態(tài)這中間的過程是比較漫長(zhǎng)的,這就中間需要更長(zhǎng)時(shí)間的模擬。
為了研究在碳管表面的吸附是否會(huì)影響HEWL的催化活性,我們?cè)谀M體系中加入了底物糖分子MG
3、M。模擬結(jié)果表明底物中兩端糖環(huán)與蛋白殘基的作用對(duì)中間糖環(huán)的固定十分重要,HEWL活性部位殘基與碳管間的作用比與與底物間的作用要強(qiáng),因此在固定化過程中應(yīng)避免活性部位殘基距碳納米管表面太近。當(dāng)活性部位殘基不在碳管表面的吸附距離范圍內(nèi)時(shí),吸附態(tài)的HEWL與底物分子間的作用相比于游離態(tài)穩(wěn)定性更強(qiáng)。
有實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,HEWL對(duì)碳納米的分散作用與超聲過程中的溫度升高有密切關(guān)系。本文選取了50℃,70℃,80℃和90℃分別進(jìn)行了50納秒
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