豬miR-378種子序列突變對其功能的影響.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本實驗使用基因克隆、Q-PCR和雙熒光素酶報告系統(tǒng)等實驗技術(shù)和方法對miR-378的種子序列突變以及突變后對miR-378功能的影響進(jìn)行了相關(guān)研究,獲得了以下結(jié)果:
  1、利用連聚合酶反應(yīng)(PCR)技術(shù)擴(kuò)增榮昌豬、內(nèi)江豬,長白豬以及杜洛克的miR-378-2基因的DNA片段,將此片段進(jìn)行測序,分析發(fā)現(xiàn):榮昌豬和內(nèi)江豬的miR-378-2基因中存在一個堿基A/G突變,長白豬和杜洛克豬中并沒有發(fā)現(xiàn)此突變。此突變位于miR-378-2

2、成熟體的種子序列,且突變能夠改變pre-miR-378的二級結(jié)構(gòu)及自由能。
  2、利用Q-PCR技術(shù)以及攜帶該突變個體的miRNA高通量測序數(shù)據(jù)對miR-378表達(dá)量進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),成熟體miR-378(野生型和突變型)主要分布于心肌、骨骼肌以及皮下脂肪等組織中,說明,miR-378分布具有組織特異性。
  3、通過構(gòu)建野生型和突變型miR-378串聯(lián)表達(dá)載體,在3T3-L1細(xì)胞中進(jìn)行體外過表達(dá)。發(fā)現(xiàn),miR-378突變后的

3、表達(dá)量極顯著高于突變前的表達(dá)量,說明,miR-378-2種子序列中A/G突變極顯著增加了miR-378-2的表達(dá)量。
  4、基于種子序列與3' UTR區(qū)的序列匹配關(guān)系,以人的基因組為參考,對野生型miR-378和突變型miR-378的靶基因進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果顯示,該突變完全改變了miR-378對靶基因的識別,突變型miR-378的靶基因的數(shù)量高于野生型miR-378的靶基因數(shù)量;對兩種軟件預(yù)測共有的靶基因進(jìn)行交集和GO分析,結(jié)果顯示

4、,野生型和突變型miR-378具有完全不同的兩種功能趨勢,野生型miR-378功能主要與RNA相關(guān)的生命過程相關(guān),部分與脂肪沉積相關(guān);突變型miR-378功能主要與蛋白的降解有關(guān),無與脂肪沉積相關(guān)的靶基因。
  5、隨機(jī)挑選部分靶基因,利用雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烌炞C突變miR-378對抑制靶基因表達(dá)功能的結(jié)果表明,miR-378突變后出現(xiàn)失去對部分靶基因的識別能力(Loss-of-function)和獲得一些新的靶基因(Gain-

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