1、大眼鱖(Siniperca kneri)，隸屬鱸形目(Perciformes)、鮨科(Serranidae)、鱖亞科(Sinipercinae)。大眼鱖是東亞地區(qū)特有的名貴魚(yú)類(lèi)，具有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。但是，近年來(lái)，由于過(guò)度捕撈、人工放流、環(huán)境污染以及水壩的修建等因素的影響，野生大眼鱖的遺傳多樣性面臨下降的趨勢(shì)。
　　本論文采用線(xiàn)粒體細(xì)胞色素b(Cytochrome b，Cytb)基因及控制區(qū)序列，對(duì)長(zhǎng)江水系大眼鱖的4個(gè)群體（赤水河群

2、體—CS、南京群體—NJ、岳陽(yáng)群體—YC、宜昌群體—YY）共計(jì)79尾個(gè)體進(jìn)行分析，探討其遺傳多樣性、遺傳分化、以及種群演化歷史，從而為有效、合理開(kāi)發(fā)利用大眼鱖資源提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)支撐。主要內(nèi)容如下:
　　1.大眼鱖的遺傳多樣性研究:Cytb分析
　　采用PCR擴(kuò)增、直接測(cè)序法，獲得4個(gè)大眼鱖群體共計(jì)79尾魚(yú)的Cytb基因全序列（長(zhǎng)度為1141bp），共檢測(cè)到26種單倍型。單倍型多樣性（Haplotypediversity，Hd）

3、指數(shù)為0.685(CS)-0.924(YY)，核苷酸多樣性(nucleotide diversity，(π))指數(shù)為0.00176(CS)-0.00285(YC)。大眼鱖群體呈現(xiàn)出高單倍型多樣性和低核苷酸多樣性的特點(diǎn)，推測(cè)群體可能經(jīng)歷過(guò)瓶頸效應(yīng)。群體內(nèi)與群體間的遺傳距離均在0.002-0.003之間。Fst統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)表明，最高水平的分化在CS和YY之間(Fst=0.12439)，最低水平的分化是在NJ與YC之間(Fst=-0.03254)

4、。分子方差（Analysis of Molecular Variance，AMOVA）、NJ、UPGMA、MP進(jìn)化樹(shù)和中間連接網(wǎng)絡(luò)圖（Median-Joining network，MJ）分析均顯示4個(gè)大眼鱖群體沒(méi)有產(chǎn)生明顯的地理分化。中性檢驗(yàn)(Neutral test)和歧點(diǎn)分布(Mismatch analysis)分析表明大眼鱖群體在歷史上曾經(jīng)歷過(guò)種群擴(kuò)張，推算擴(kuò)張時(shí)間為11.4萬(wàn)年左右。
　　2.大眼鱖的遺傳多樣性研究:D-l

5、oop分析
　　采用PCR擴(kuò)增、直接測(cè)序法，獲得4個(gè)大眼鱖群體共計(jì)79尾魚(yú)的D-loop全序列（長(zhǎng)度為834-840bp），共檢測(cè)到46種單倍型。單倍型多樣性(Haplotypediversity，Hd)指數(shù)為0.754(CS)-0.990(NJ)，核苷酸多樣性(nucleotide diversity，(π))指數(shù)為0.00548(CS)-0.01412(YY)。群體內(nèi)遺傳距離在0.005-0.014之間，其中，CS群體內(nèi)的遺傳

6、距離最小，為0.005;YY群體內(nèi)的遺傳距離最大，為0.014。群體間的遺傳距離在0.008-0.012之間，YY群體與其它三個(gè)群體間的遺傳距離較大。Fst統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)表明，最高水平的分化在CS和YY之間(Fst=0.08435)，最低水平的分化是在NJ與YC之間(Fst=-0.00943)。分子方差(Analysis of MolecularVariance，AMOVA)、NJ、UPGMA、MP進(jìn)化樹(shù)和中間連接網(wǎng)絡(luò)圖(Median-Joi