辣椒疫霉效應分子RXLR23的表達、純化與晶體結構初步研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、辣椒疫霉(Photophthora capsici)是一種具有很大危害性的蔬菜病原菌,侵染寄主范圍廣,包括辣椒、番茄、茄子、瓜類等多種茄科及葫蘆科植物。隨著這種病害的發(fā)生率和嚴重程度在逐年提高,人們對它的關注程度也在提高。近年來,辣椒疫病發(fā)生嚴重導致辣椒的減產,人們開始利用新的途徑來研究辣椒疫霉的致病機制,隨之越來越多的致病基因被發(fā)現(xiàn)。寄主和病原物之間的互作符合基因對基因假說( gene-for-gene hypothesis)。當抗病

2、植物的抗病基因編碼的蛋白識質別病原物的無毒基因編碼的蛋白質時,植物的免疫反應被激活。無毒基因也被稱為是效應基因。隨著辣椒疫霉的基因組由美國能源部基因研究所(JGI)公布,許多效應基因被預測,但相關基因結構生物學還沒有研究透徹。
  近年,卵菌效應因子轉運機制成為病原物-寄主互作的熱點問題,由于大部分的效應蛋白是胞內蛋白,而這些蛋白如何進入到植物體內,仍然還存在問題,本文試圖通過研究轉運機制以及植物抗病機制,為病害生物防治和選育抗病

3、品種奠定重要基礎。
  本研究通過生物信息學分析,從辣椒疫霉基因組中克隆到多個效應基因,成功通過體外原核表達和純化獲得高純度和高濃度的蛋白質,最終得到一個效應分子蛋白晶體結構,其分辨率為3.2?,具體總結如下:
  1.通過生物信息學預測和分析,從辣椒疫霉的cDNA中克隆到50多個無毒基因,能夠在原核表達系統(tǒng)成功表達和純化的有3個基因,其氨基酸序列同源性很低,N端RxLR-deer基序保守及C端功能區(qū)存在很大差異,本研究主要

4、以其中的RLXR23作為主要研究對象。
  2.重組蛋白質 RXLR23通過親和層析,離子交換層析和分子排阻層析純化,得到穩(wěn)定和高純度蛋白質,由于RXLR23結構同源性<30%,不能通過分子置換法解析結構,需要通過硒代蛋白來求解相位,硒代蛋白與native蛋白的表達和純化方法一致。
  3.本研究通過蒸汽擴散法中的懸滴法和坐滴法得到初步蛋白晶體,利用懸滴法優(yōu)化最終得到高質量的蛋白晶體用于 X衍射,利用單波長反常散射法求解相位

5、,最終解析RXLR23晶體結構,該蛋白以二聚化的形式行使其功能。
  4.目前報道的某些效應因子能夠與寄主質膜上的3-磷酸磷脂酰肌醇(PI3P)結合,可使效應因子直接進入到寄主細胞內,本研究試圖通過RXLR23與PI3P的結合,在三維空間結構中解釋效應分子與之結合的位點,利用蛋白表達純化技術和晶體學技術,最終得到復合物晶體。
  5.在晶體優(yōu)化過程中,初始得到的晶體質量衍射分辨率只有8?左右,通過截短,脫水,更換防凍液等方法

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