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文檔簡介
1、大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)是十字花科蕓薹屬蔬菜,典型的雌雄同花異交作物;是我國人民日常生活中不可或缺的重要蔬菜,在農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)中地位相對突出,尤其在北方高寒地區(qū),是冬春主要的蔬菜種類,栽培面積和消費(fèi)量均居各類蔬菜之首。隨著生物種群的進(jìn)化,大白菜自交普遍存在生活力衰退現(xiàn)象,其自交衰退主要特征表現(xiàn)為抗病性減弱、單株重降低、結(jié)球性降低,植株生長勢減弱、種株生活力下降。從遺傳角度,人們對物種的自交衰退做了
2、大量研究,但沒有取得實(shí)質(zhì)性進(jìn)展,因此研究大白菜自交衰退的分子機(jī)理具有重要的意義。
本試驗(yàn)通過對大白菜自交衰退前后結(jié)球性的調(diào)查,采用酶聯(lián)免疫法檢測衰退前后大白菜內(nèi)源激素含量,并利用Illumina高通量測序和Bisulfite-Seq測序技術(shù)對植物材料A209自交衰退前后進(jìn)行全基因組甲基化測序和轉(zhuǎn)錄組測序;通過對結(jié)球性與激素含量、基因表達(dá)、全基因組甲基化水平的聯(lián)合分析,探討大白菜自交衰退與基因組DNA甲基化的關(guān)系,取得如下結(jié)論:
3、
(1)通過對高代自交系A(chǔ)209(12067)及衍生后代A209(13358)的結(jié)球性調(diào)查,發(fā)現(xiàn)高代自交導(dǎo)致結(jié)球性退化。
(2)對衰退前后植株的苗期、蓮座期、結(jié)球期進(jìn)行內(nèi)源激素測定,發(fā)現(xiàn)衰退后植株生長素含量降低。
(3)衰退前后基因組DNA甲基化水平發(fā)生變化,衰退材料整體甲基化水平降低;但差異表達(dá)基因中,衰退材料甲基化水平升高的多于降低的。
(4)衰退前后總計(jì)檢測到31066個(gè)基因表達(dá)發(fā)生變化,其
4、中上調(diào)表達(dá)14735個(gè),下調(diào)表達(dá)16331個(gè),顯著差異表達(dá)基因共7274個(gè),顯著率達(dá)到23.48%。
(5)對甲基化相關(guān)基因BrDRM2、BrDDM1,進(jìn)行qPCR相對表達(dá)分析,衰退材料的基因表達(dá)水平上升,相對表達(dá)分析與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果表達(dá)一致。
(6)對生長素合成關(guān)鍵基因BraIAA30與生長素極性運(yùn)輸相關(guān)基因BrPIN5、BrARF19進(jìn)行qPCR相對表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)衰退后BrIAA30、BrPIN5、BrARF19
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