羅非魚微衛(wèi)星DNA指紋圖譜的構建及其在種質鑒定中的應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本論文以羅非魚三個種共240個樣品為試材,利用微衛(wèi)星標記篩選可作為三種羅非魚鑒定標準的特異位點,構建了代表三種羅非魚品種種質的DNA指紋圖譜,具體研究內容如下: 1、利用微衛(wèi)星技術進行了三種羅非魚的分子鑒定研究,通過參考GenBank和已報道的序列,挑選103個微衛(wèi)星位點的引物,對奧利亞、尼羅和橙色莫桑比克羅魚進行PCR擴增,獲得具有穩(wěn)定擴增產物的位點77個,篩選其中17個微衛(wèi)星特異位點,用于三種羅非魚的種質鑒定。 2、

2、三種羅非魚微衛(wèi)星DNA指紋圖譜的構建。我們應用擴增穩(wěn)定、清晰的82個微衛(wèi)星位點,對奧利亞、尼羅和橙色莫桑比克三種羅非魚共240個體進行擴增分析,一共檢測出605個等位基因,在相同遷移率位置上以1或0記錄擴增片段的有或無,形成每個羅非魚個體對應的指紋數碼。采用數據庫軟件管理這些數碼,形成三種羅非魚的等位基因數據庫,根據數據庫中每個等位基因的大小,利用Excel作圖工具構建了三種羅非魚的DNA指紋模式圖,用盡可能多的位點呈現出三種羅非魚整體

3、的遺傳概貌。從圖譜可明顯看出尼羅羅非魚的多態(tài)性水平最高,奧利亞和莫桑比克羅非魚的多態(tài)性水平都較低。利用在奧利亞、尼羅和莫桑比克羅非魚中具有獨有條帶的16對微衛(wèi)星核心引物組合,產生了數字化的DNA指紋代碼,用于三種羅非魚及其雜交種的鑒定。 3、為方便處理和應用于實踐,根據等位基因數據庫為背景,運用Visual basic6.0,開發(fā)了基于Windows XP操作平臺的鑒定軟件——珠江水產研究所魚類種質鑒定軟件1.0(PRIFRIL

4、0)。 4、運用38個微衛(wèi)星標記對奧利亞、尼羅和橙色莫桑比克三種羅非魚8個群體的遺傳多樣性和遺傳分化進行了研究。對三種羅非魚而言,尼羅羅非魚的平均等位基因數(6.42)、平均觀測雜合度(0.5263)、平均多態(tài)信息含量(0.3500)最高,橙色莫桑比克羅非魚平均等位基因數(2.0789)、平均觀察雜合度(0.3052)、平均多態(tài)信息含量(0.2644)最低。聚類分析顯示,奧利亞與橙色莫桑比克羅非魚的親緣關系較近,這與前人結果一致

5、。尼羅羅非魚中高要、番禺和鷺業(yè)群體的遺傳分化顯著(Fst為0.1-0.8202),相對而言奧利亞羅非魚高要83系、高要02系、番禺和鷺業(yè)群體的遺傳分化不顯著(Fst為0-0.3918),這些表明我國尼羅羅非魚的遺傳多樣性較高,表明尼羅羅非魚仍具有一定的選育潛力,奧利亞和橙色莫桑比克羅非魚的遺傳多樣性相對較低。國內外目前對于這兩種羅非魚,則保持這些良種羅非魚的遺傳純度,選擇體質較好的個體進行雜交選育,產生雄性率高等具有明顯雜交優(yōu)勢的雜種魚

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