甘肅河西走廊地區(qū)錦雞兒的SSR分析.pdf_第1頁(yè)
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1、錦雞兒是豆科錦雞兒屬多年生灌木植物,具有很高的飼用和藥用等價(jià)值,是防風(fēng)固沙的先鋒植物。本研究結(jié)合具體的研究條件,采用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)來自甘肅河西走廊地區(qū)的14種錦雞兒進(jìn)行遺傳多樣性分析和聚類比較,旨在錦雞兒的遺傳育種研究提供必要的依據(jù)。研究結(jié)果如下:   1.在利用SSR技術(shù)研究錦雞兒遺傳多樣性過程中,從引物篩選、擴(kuò)增條件、檢測(cè)方法等幾個(gè)方面進(jìn)行優(yōu)化,建立錦雞兒SSR最適合的反應(yīng)體系為:10μL的PCR反應(yīng)體系:模板DNA2

2、0ng/μL,引物濃度為1.5μmol/L,dNTP濃度為0.20mmol/L,Mg2+濃度為2.0mmol/L,TaqDNA聚合酶為1U。SSR的PCR擴(kuò)增條件為:95℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s,53℃退火1min,72℃延伸1min,共30個(gè)循環(huán),72℃延伸10min。cpSSR的PCR擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s,54℃退火11Os,72℃延伸1min,共30個(gè)循環(huán),72℃延伸8min。在此優(yōu)

3、化體系下,可以得到重復(fù)性好、穩(wěn)定且多態(tài)性高的SSR條帶。   2.從66對(duì)SSR大豆引物中篩選出9對(duì)多態(tài)性SSR引物,引物多態(tài)率為13.64%。從40對(duì)葉綠體SSR(epSSR)大豆引物篩選出10對(duì)cpSSR多態(tài)性引物,引物多態(tài)率為25%。9對(duì)SSR引物共檢測(cè)到109個(gè)等位變異,平均每個(gè)引物檢測(cè)到11個(gè)等位變異。引物等位位點(diǎn)多態(tài)性信息量PIC變幅在0.320~0.921之間,平均為0.738。Shannon指數(shù)變幅在0.246~

4、0.486之間,平均為0.342。10對(duì)葉綠體SSR共檢測(cè)到92個(gè)等位變異,平均每個(gè)引物檢測(cè)到9個(gè)等位變異。引物等位位點(diǎn)多態(tài)性信息量PIC變幅在0.512~0.865之間,平均為0.671。Shannon指數(shù)變幅在0.308~0.500之間,平均為0.444。   3.14種錦雞兒間的Nel’s遺傳相似系數(shù)(Gs)在0.60~0.92之間,平均GS為0.76。14種錦雞兒的遺傳相似性變幅大,種闖的遺傳相似性依物種的變化而各異,存

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