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![煙草腋芽發(fā)育相關基因的克隆與功能分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/e00bd507-7192-47e1-b588-a7e5285bbf51/e00bd507-7192-47e1-b588-a7e5285bbf511.gif)
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文檔簡介
1、植物分枝發(fā)育在植物形態(tài)建成中具有十分重要的地位。研究表明,植物的分枝發(fā)育過程受遺傳因素和環(huán)境條件等的共同影響。對植物側枝發(fā)育有顯著調控作用的基因大部分屬于GRAS、TCP或R2R3-MYB基因家族,這三個基因家族均編碼植物轉錄因子。其中,GRAS基因家族成員在植物生長發(fā)育的許多方面發(fā)揮重要的作用;TCP家族是一類與植物器官三維形態(tài)發(fā)育以及細胞周期調控相關的轉錄因子;R2R3-MYB轉錄因子廣泛參與植物的初生和次生代謝、響應生物和非生物脅
2、迫等過程。本研究對煙草全基因組內GRAS和TCP基因家族進行了鑒定和生物信息學分析,在此基礎上,分別克隆了屬于GRAS基因家族的煙草NtLS基因、屬于TCP基因家族的NtBRC1-Like基因和屬于R2R3-MYB基因家族的NtRAX2基因,它們的直系同源基因都與植物側枝發(fā)育相關。對NtLS和NtRAX2基因進行過表達分析、基因沉默研究以及擬南芥互補實驗驗證,探索其對煙草腋芽發(fā)生和發(fā)育的影響,為利用遺傳操作培育無腋芽或少腋芽的煙草新種質
3、奠定基礎。本文獲得的主要結果如下:
(1)在煙草基因組中鑒定了95個GRAS家族成員,根據(jù)系統(tǒng)進化的分析結果將它們分為十個亞家族。所有的NtGRAS成員都含有5個高度保守的motif,分別是LHRⅠ、VHIID、LHRⅡ、PFYRE和SAW。該基因家族中約88.42%的基因沒有內含子,有定位信息的84個成員分布在煙草的22條染色體上。煙草GRAS基因參與很多生物學過程的調控,約74%的NtGRAS蛋白是細胞核定位。被選取進行熒
4、光定量分析的22個NtGRAS基因中人多數(shù)在根和葉片的表達量最高。
(2)在煙草基因組中鑒定了61個TCP家族成員,根據(jù)系統(tǒng)進化的分析結果將它們分為ClassⅠ和ClassⅡ兩個亞家族,其中ClassⅡ又可以分為CIN和CYC/TB1亞簇。所有的NtTCP蛋白都含有高度保守的TCP-domian,有12個成員還另外包含一個R-domian,這12個NtTCP蛋白中有10個屬于CYC/TB1亞簇。該基因家族中約67.2%的基因沒
5、有內含子,有定位信息的54個成員分布在煙草的20條染色體上。被選取進行熒光定量分析的22個NtTCP基因中絕大多數(shù)在葉片的表達量最高。
(3)從普通煙草中克隆了NtLS基因的2條拷貝,NtLS-S和NtLS-T,前者來自于林煙草,后者來自于絨毛狀煙草。二者序列極為相似,且都沒有內含子,分別與GRAS基因家族中的NtLS和NtLSa基因相對應。NtLS-S和NtLS-T基因的表達模式與番茄LeLS、擬南芥AtLAS和菊花DgLS
6、L的表達模式相似。對NtLS基因構建過表達載體和CRES-T載體并進行遺傳轉化,獲得的T0代過表達轉基因煙草比非轉基因煙草更早出現(xiàn)腋芽,而且NtLS-S基因能恢復擬南芥las突變體的表型。
(4)從普通煙草中克隆了4個NtBRC1-Like基因,命名為NtBRC1-Like1、2、3和4,分別與TCP基因家族中的NtTCP18a、b、c和d相對應。這4個基因屬于與植物側枝發(fā)育相關的CYC/TB1亞家族,且NtBRC1-Like
7、1/4、 NtBRC1-Like2/3兩兩的遺傳距離較近。4個NtBRC1-Like基因編碼的蛋白除具有核心的TCP-domain外,還具有CYC/TB1簇蛋白特有的R-domain。4個NtBRC1-Like基因在不同的組織中呈現(xiàn)特異性表達,且其表達模式可分為兩種:NtBRC1-Like1和4的表達模式相似,在腋芽中高度表達;NtBRC1-Like2和3的表達模式十分相像,在葉和腋芽中的表達量都顯著高于其它組織。NtBRC1-Like
8、2和3被證實是NtBRC1b基因分別來自于林煙草和絨毛狀煙草的2條拷貝,NtBRC1b-S和NtBRC1b-T。為了探索NtBRC1b基因的功能,對其構建了過表達載體,正在研究其功能。
(5)從普通煙草中克隆了NtRAX2基因的2條拷貝,來自于林煙草的NtRAX2-S和來自于絨毛狀煙草的NtRAX2-L二者序列高度相似。NtRAX2-S和NtRAX2-T在腋芽和花中高度表達,在花芽和莖尖中的表達也維持較高的水平。對NtRAX2
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