HLa-DP-HLa-DQ基因多態(tài)性與乙肝病毒感染及進(jìn)展易感性的關(guān)聯(lián)研究.pdf_第1頁(yè)
已閱讀1頁(yè),還剩106頁(yè)未讀 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡(jiǎn)介

1、目的:乙肝病毒感染及其進(jìn)展的疾病是常見(jiàn)而且影響重大的感染性疾病之一,目前全球約2億4千萬(wàn)人群為慢性乙肝病毒感染,目前中國(guó)不少地區(qū)仍為乙肝高流行區(qū),每年因乙肝感染病情加重死亡的患者多達(dá)5萬(wàn)人。影響乙肝病毒感染因素中,宿主遺傳特性被發(fā)現(xiàn)對(duì)乙肝病毒感染及進(jìn)展有重要影響。近年來(lái)發(fā)表的幾個(gè)全基因組關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn)了位于6號(hào)染色體HLA基因家族上的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNP)與乙肝病毒感染及感染后疾病進(jìn)展密切相關(guān)。HLA基因家族富集了多個(gè)免疫相關(guān)蛋白的

2、編碼區(qū),我們將通過(guò)對(duì)這一區(qū)域(主要是HLA-DP/DQ基因簇)的精細(xì)定位來(lái)發(fā)現(xiàn)更多的影響乙肝病毒感染的基因位點(diǎn),研究這些位點(diǎn)的作用模式、相互影響以及對(duì)感染后疾病進(jìn)展的影響。
  方法:我們?cè)诒狙芯恐惺占?440例健康人和1648例乙肝感染者的樣本,分別提取DNA后使用zju-iselect定制芯片對(duì)HLA基因區(qū)域進(jìn)行了高密度的SNP位點(diǎn)基因分型精細(xì)定位。之后對(duì)芯片數(shù)據(jù)結(jié)果分別用PLINK軟件和Haploview軟件做單個(gè)SNP位

3、點(diǎn)和各連鎖區(qū)塊(linkage block,LD)上單倍型的關(guān)聯(lián)分析以及條件關(guān)聯(lián)分析,另外還使用R語(yǔ)言程序包haplo.stats作單倍型結(jié)果的校正。同時(shí)通過(guò)將病例組對(duì)照組分為亞組,我們還做了亞組之間比較分析。
  結(jié)果:本次研究發(fā)現(xiàn)所研究的SNP中有76個(gè)SNP(位于HLA-DP/DQ基因簇)與乙肝病毒感染顯著相關(guān),這些SNP所構(gòu)成的5個(gè)連鎖區(qū)塊也經(jīng)分析發(fā)現(xiàn)與感染顯著相關(guān),其中位于HLA-DPB1的SNP位點(diǎn)rs9277535,

4、P值達(dá)到3.88×10-18。進(jìn)一步條件關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)了基因簇HLA-DP、HLA-DQ與疾病的關(guān)聯(lián)性之間是相互獨(dú)立的,而在這兩個(gè)基因簇內(nèi)部各連鎖區(qū)塊之間則存在相互影響,其中HLA-DPB13'-UTR區(qū)的SNP(LD block5)對(duì)HLA-DP與疾病的關(guān)聯(lián)性起到主要作用。另外我們還通過(guò)比較乙肝病毒攜帶者和慢性乙肝患者,慢性乙肝患者和肝硬化患者對(duì)疾病組進(jìn)行了亞組分析,未發(fā)現(xiàn)HLA區(qū)塊存在與疾病進(jìn)展顯著相關(guān)的SNP位點(diǎn)。同時(shí)我們進(jìn)行了疾病

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評(píng)論

0/150

提交評(píng)論