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![用RNAi及芯片技術(shù)對肝癌細(xì)胞中DNMT3B下游基因的初步鑒定.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/13/6b660100-6f95-4177-b130-a4d1fec09bfa/6b660100-6f95-4177-b130-a4d1fec09bfa1.gif)
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文檔簡介
1、目的:探索DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3B(DNMT3B)在腫瘤發(fā)生中的作用。探查DNMT3 B在人正常肝細(xì)胞株、肝癌癌旁及肝癌細(xì)胞株中的蛋白表達(dá)水平,然后在肝癌細(xì)胞系中通過載體介導(dǎo)的RNA干擾抑制DNMT3B的表達(dá),分析與鑒定DNMT3B下游基因表達(dá)譜。 方法:用Western blotting及細(xì)胞免疫化學(xué)分析:DNMT3 B蛋白在人正常肝細(xì)胞株、肝癌癌旁及肝癌細(xì)胞株的表達(dá)。RNAi重組載體pSL/PER-EGFP-MT3B轉(zhuǎn)染肝癌細(xì)胞
2、株SMMC-7721。通過RT-PCR及Western blotting方法鑒定DNMT3B的抑制效率。用cDNA基因芯片分析基因表達(dá)譜。 結(jié)果:DNMT3B在肝癌細(xì)胞株中的表達(dá)水平明顯高于肝癌癌旁和正常肝細(xì)胞株。通過RNAi,DNMT3B在肝癌細(xì)胞系中的表達(dá)被抑制,RNA干擾的抑制效率>80﹪。當(dāng)DNMT3B表達(dá)抑制后,有115條基因表達(dá)上調(diào),26條基因表達(dá)下調(diào),其中包括一些重要的發(fā)育相關(guān)基因以及腫瘤相關(guān)基因,比如.SNCG、
3、NOTCH、MBD3、WNTll、MAOA、FACL4等。 結(jié)論:DNMT3 B在肝癌細(xì)胞株中表達(dá)水平顯著高于正常肝細(xì)胞株以及癌旁細(xì)胞株。在肝癌細(xì)胞系中,RNA干擾能有效的抑制DNMT3B的表達(dá)。 在DNMT3B經(jīng)過RNAi后,表達(dá)水平改變了的基因可能是DNMT3B調(diào)控的下游基因,DNMT3B或許是通過甲基化的作用對這些基因的表達(dá)起到了重要的調(diào)控作用。因此,DNMT3B可能是通過對下游基因甲基化作用的調(diào)控來控制下游基因的
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