羅漢果轉(zhuǎn)錄組、表達(dá)譜的高通量測(cè)序及甜苷V生物合成關(guān)鍵酶的克隆.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、羅漢果Siraitiagrosvenorii(Swingle)C.Jeffrey是我國(guó)特有珍貴藥用和甜料植物,為葫蘆科(Cucurbitaceae)羅漢果屬(Siraitia)多年生藤本植物,具有止咳祛痰、涼血舒胃、潤(rùn)腸通便等作用。其主要成分甜苷V是世界上最強(qiáng)的非糖甜味物質(zhì)之一,為蔗糖甜度的300-400倍,是一種低熱量、純天然的甜味劑及理想的保健品,此外還有抗氧化、免疫調(diào)節(jié)、抗癌、降血糖等作用。甜苷V目前還不能化學(xué)合成,主要依靠提取獲

2、得。羅漢果對(duì)生境要求苛刻,只適宜在廣西生長(zhǎng),且栽培中不能連作,果實(shí)中甜苷V含量低,無(wú)法滿(mǎn)足市場(chǎng)需求,因此亟待探索提高甜苷V含量的新途徑、新方法。本論文利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)羅漢果果實(shí)的轉(zhuǎn)錄組和表達(dá)譜進(jìn)行了研究,從分子水平闡釋羅漢果甜苷V生物合成的分子機(jī)理,大規(guī)模尋找羅漢果功能基因,并在此基礎(chǔ)上克隆了甜苷V生物合成相關(guān)基因的全長(zhǎng)。主要研究結(jié)果如下:
   1.羅漢果授粉后30天到50天之間主要以苦味成分苷ⅡE為主,70天時(shí)含量急劇下

3、降,檢測(cè)不到苷ⅡE。苷Ⅲ只在50天果實(shí)中出現(xiàn)。苷V含量在50天之前含量低,在50天至70天之間急劇增長(zhǎng)了25.9倍,至85天增長(zhǎng)到最高含量。葡萄糖含量在30天和50天變化不明顯,而70天下降了3.24倍。葡萄糖含量與苷ⅡE、苷V含量的變化存在一定的消長(zhǎng)關(guān)系。
   2.應(yīng)用Solexa高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)羅漢果果實(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,得到3.41G的原始數(shù)據(jù),通過(guò)拼接得到43891條Unigenes。與次生代謝相關(guān)的unigenes有7

4、39條,其中涉及萜類(lèi)骨架合成的Unigenes有60條。利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)了羅漢果甜苷V生物合成通路中幾乎所有的基因,涉及到20種基因。另外還得到了80條P450基因Unigenes、72條glycosyltransferase基因的Unigenes和90條glucosyltransferase基因的Unigenes。這些Unigenes是今后對(duì)羅漢果三萜皂苷生物合成進(jìn)行全面調(diào)控的重要基因資源。
   3.在3d、50d、70d

5、表達(dá)譜中均得到了300萬(wàn)條以上Cleantags,去冗余后得到85000條以上不同種類(lèi)的Tags。通過(guò)分析發(fā)現(xiàn)占mRNA總量近73-76%的是種類(lèi)不到5.1-5.9%的少數(shù)mRNA,而占種類(lèi)56-59%的mRNA全部加起來(lái)不到mRNA總量的3.9-4.1%。對(duì)差異基因進(jìn)行統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn)在3d/50d中,有2119個(gè)基因上調(diào),2642個(gè)基因下調(diào);3d/70d中,2150個(gè)基因上調(diào),2797個(gè)基因下調(diào);50d/70d中,1078個(gè)基因上調(diào),142

6、2個(gè)基因下調(diào)。
   4.利用表達(dá)譜對(duì)羅漢果甜苷V生物合成途徑涉及的20種基因在各個(gè)時(shí)期的表達(dá)水平進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn)除AACT、MVD、CMK、HDS、SQS基因表達(dá)量在3個(gè)時(shí)期中未見(jiàn)明顯變化外,其余16個(gè)基因都有各自的變化規(guī)律。授粉后3天到50天之間,DXS、DXR、MCS、IDS下調(diào),其余12種基因均上調(diào)。50天到70天之間,HMGR、MCS、IDS、IPP、GPS、FPS、CAS下調(diào)外,其余9種個(gè)基因均上調(diào)。從3天幼果到70天接

7、近成熟果實(shí),各個(gè)基因表達(dá)的總體趨勢(shì)是:除DXR、MCS、IDS、IPP-Ⅰ表現(xiàn)下調(diào)外,HMGS、HMGR、MK、PMK、MCT、IPI-Ⅱ、GPS、FPS、SQS、CAS和CS基因均上調(diào)。其中SQE和CS變化最大,70天比3d的表達(dá)量分別提高了8.89倍和9.69倍。
   5.通過(guò)對(duì)80條CytochromeP450Unigenes和90條glucosyltransferaseUnigenes基因表達(dá)水平變化規(guī)律進(jìn)行研究,推測(cè)

8、Unigene23541、Unigene24189、Unigene26598和Unigene43109等4條候選的P450基因和Unigene4016、Unigene8672、Unigene13633、Unigene15400、Unigene35056和Unigene38974等6條候選的UDPG基因可能參與甜苷V骨架生物合成。
   5.利用RACE技術(shù)首次克隆了14條羅漢果甜苷V生物合成相關(guān)的基因全長(zhǎng)和4條5’或3’片段。其

9、中MVA途徑有6條:AACT、HMGS、HMGR、MK、PMK、MVD;共同代謝途徑中IPI、GPS、FPS、SQS、CAS、CS等6條,以及SQE5’端;MEP途徑中MCT和IDS基因的全長(zhǎng)、DXS和HDS的5’端以及MCS的3’端。此外還得到了2條糖基轉(zhuǎn)移酶的全長(zhǎng)。并對(duì)所有全長(zhǎng)基因進(jìn)行了序列分析,它們均為首次從羅漢果中報(bào)道的全長(zhǎng)或部分片段序列。
   本論文首次利用Solexa高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)羅漢果果實(shí)的轉(zhuǎn)錄組及不同時(shí)期的表

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