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文檔簡(jiǎn)介
1、肺癌(lung cancer)是全世界發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤之一,非小細(xì)胞肺癌約占肺癌總數(shù)的80-85%,嚴(yán)重影響人們的生活質(zhì)量。目前,關(guān)于這類(lèi)疾病的發(fā)病機(jī)理仍然不清楚,其發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)理亟待闡明。近年來(lái)質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展迅速,為腫瘤研究提供了有力的研究手段。本實(shí)驗(yàn)利用2D LC-MS/MS蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái),結(jié)合同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量(isobaric Tags for Relative andAbsolute Quantitati
2、on,iTRAQ)技術(shù)以及SWATHTM(Sequential WindowedAcquisition of all Theoretical fragment ions,SWATHTM)非標(biāo)記定量技術(shù)分析比較一對(duì)具有不同轉(zhuǎn)移潛能肺癌細(xì)胞系SPC-A-1 sci和SPC-A-1的差異分泌蛋白,篩選肺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)分子。
第一部分:血清蛋白組分析方法的初步建立。利用安捷倫免疫親和色譜系統(tǒng)有效去除人血清中14個(gè)血清高豐度蛋白,有利于下一
3、步質(zhì)譜鑒定出更多血清低豐度蛋白,為之后的實(shí)驗(yàn)研究奠定基礎(chǔ)。去除高豐度蛋白后的血清,利用iTRAQ標(biāo)記定量方法定量比較正常人與肺癌早期、中期及晚期病人的血清蛋白。
第二部分:NSCLC轉(zhuǎn)移相關(guān)分泌蛋白的定量分析。利用iTRAQ標(biāo)記定量技術(shù)和SWATHTM非標(biāo)記定量技術(shù)同時(shí)分析SPC-A-1sci和SPC-A-1的差異分泌蛋白,并分析、整合兩種方法的定量效果,結(jié)果顯示在兩種方法中重復(fù)鑒定與定量的蛋白有326個(gè),差異表達(dá)的蛋白110
4、個(gè),經(jīng)過(guò)生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)軟件預(yù)測(cè),有96%的蛋白可通過(guò)分泌途徑分泌。應(yīng)用實(shí)時(shí)定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)與蛋白質(zhì)印跡法(Western blot)檢測(cè)差異蛋白在基因與蛋白水平的表達(dá)情況,結(jié)果與質(zhì)譜定量趨勢(shì)基本一致。
此外,運(yùn)用第一部分中蛋白組學(xué)分析血清的方法,比較早期肺癌病人組(Ⅰ和Ⅱ期)和晚期肺癌病人組(Ⅲ和Ⅳ期)的血清差異蛋白,共鑒定差異蛋白71個(gè)。ELISA檢測(cè)質(zhì)譜鑒定
5、結(jié)果中差異最顯著的蛋白(Complement C3)在血清樣本中的表達(dá)情況,結(jié)果與質(zhì)譜分析一致。結(jié)合血清和分泌上清的差異表達(dá)數(shù)據(jù)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)CD109同時(shí)在晚期肺癌病人和高轉(zhuǎn)移潛能肺癌細(xì)胞高表達(dá),提示其可能與肺癌發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),具有潛在研究?jī)r(jià)值。
第三部分:CD109表達(dá)量檢測(cè)及生物功能的初步研究。qRT-PCR檢測(cè)CD109在72對(duì)肺癌病人癌和癌旁組織中的表達(dá),顯示CD109在癌組織中顯著增高,且在低分化肺癌組織中高表達(dá)。E
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