原發(fā)性高血壓與線粒體ND6基因變異的相關(guān)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:
  1.收集原發(fā)性高血壓(Essential Hypertension,EH)患者的臨床資料及外周血樣本,建立EH患者臨床資料數(shù)據(jù)庫及線粒體基因組遺傳數(shù)據(jù)庫。
  2.開展EH患者線粒體ND6基因變異篩查,繪制ND6基因的突變譜。
  3.分析EH的發(fā)生發(fā)展與線粒體ND6基因變異的相關(guān)性。
  方法:
  1.根據(jù)2010年版《中國高血壓防治指南》EH的診斷標(biāo)準(zhǔn),選取中國漢族人群中無血緣關(guān)系的119

2、5例EH患者為病例組;443例健康人群為對照組,共1638例,收集相應(yīng)臨床資料及外周血樣本。
  2.提取1638例受試對象的外周血全基因組DNA。
  3.采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)對線粒體ND6基因片段進行特異性的擴增,并通過瓊脂糖凝膠電泳對擴增產(chǎn)物進行檢測,然后對相應(yīng)片段進行DNA測序并分析。
  4.使用Codoncode aligner、Chromas和D

3、NA star3種生物信息分析軟件將ND6基因片段的測序結(jié)果與最新的劍橋參考序列(revised Cambridge ReferenceSequence,rCRS)比對,進而分析線粒體ND6基因變異數(shù)據(jù),并對結(jié)果進行統(tǒng)計學(xué)分析。
  5.使用Clustal X軟件和對應(yīng)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)資源庫,分析病例組線粒體ND6基因所攜帶的基因變異位點在14個靈長類物種間的保守性系數(shù)(ConservationIndex,CI)和對應(yīng)氨基酸的改變情況。

4、
  6.使用SOSUI在線分析軟件,分析蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的改變情況,并統(tǒng)計分析線粒體ND6基因變異與EH的相關(guān)性。
  結(jié)果:
  1.病例組與對照組的臨床資料統(tǒng)計分析結(jié)果顯示,兩組的性別構(gòu)成無顯著性差異(表8,P值=0.918>0.05)。
  2.病例組1級高血壓患者攜帶ND6基因變異與對照組存在統(tǒng)計學(xué)差異(表11,x2為7.281,P值=0.007<0.05)。病例組2級高血壓患者攜帶ND6基因變異與對照組

5、存在統(tǒng)計學(xué)差異(表11,x2為10.723,P值=0.001<0.05)。2級高血壓受試樣本兩組間攜帶≥2個線粒體ND6基因變異的情況存在明顯差異(表12,x2為5.101,P值=0.024<0.05)。
  3.將不同年齡段的受試樣本的基因變異攜帶情況進行統(tǒng)計分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)1級高血壓49~58歲組(表13,x2為5.277,P值=0.022<0.05),2級高血壓39~48歲組和59~68歲組兩組間分別存在統(tǒng)計學(xué)意義(表13,x

6、2為14.895,P值=0.000<0.05; x2為5.104,P值=0.024<0.05)。
  4.PCR擴增1195例病例組和443例對照組的線粒體ND6基因,測序分析后顯示病例組有476例樣本攜帶線粒體ND6基因變異,對照組有176例樣本攜帶線粒體ND6基因變異。
  5.病例組篩查線粒體ND6基因共有66個變異,其中基因變異頻率為13.75×10-2/bp(66/480bp);對照組共有40個變異,基因變異頻率為

7、8.33×10-2/bp(40/480bp);病例組與對照組共篩查到基因變異74個。經(jīng)x2檢驗,結(jié)果顯示病例組和對照組的線粒體ND6基因變異發(fā)生頻率存在顯著差異(表14,P值=0.008<0.05)。
  6.病例組ND6基因變異中有20個錯義突變,46個同義突變;對照組則有11個錯義突變,29個同義突變。
  7.病例組攜帶46個同義突變,占69.70%,其中35個基因變異CI≥78%,其病例組總變異頻率為17.41%,且

8、35個CI≥78%的基因變異中,對照組14個變異未發(fā)現(xiàn),而病例組總變異頻率為1.81%。病例組攜帶的46個同義突變中,存在3個基因變異ND6A14320G、A14617G和C14671T在MITOMAP數(shù)據(jù)資料庫中未報道,且這3個變異的CI均≥78%,其中ND6 A14320G位于基質(zhì)區(qū),ND6 A14617G和C14671T位于跨膜區(qū),而且A14320G和C14671T在對照組中未發(fā)現(xiàn)。
  8.病例組攜帶20個錯義突變,占30

9、.30%,其中5個基因變異CI≥78%。這5個高度保守的錯義突變中,14496位點的CI為100%,在MITOMAP數(shù)據(jù)庫未報道過;14598位點的CI也為100%,此基因變異在對照組和MITOMAP2704例數(shù)據(jù)庫中未發(fā)現(xiàn)。病例組攜帶的20個錯義突變中,10個錯義突變對照組中未發(fā)現(xiàn),其病例組總變異頻率為17.41%,且ND6 G14226A的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測發(fā)生了改變,病例組變異頻率為0.25%。
  9.在ND6蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)上

10、,基質(zhì)區(qū)存在21個基因變異,包括10個錯義突變,占13.51%,11個同義突變,占14.86%;跨膜區(qū)存在45個基因變異,包括11個錯義突變,占14.86%,34個同義突變,占45.95%;膜間區(qū)存在8個同義突變,占10.81%。
  10.ND6蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測,發(fā)現(xiàn)3個錯義突變ND6 G14226A,T14318C和C14340T導(dǎo)致ND6亞基的二級結(jié)構(gòu)改變,其中ND6 G14226A位于第5跨膜區(qū),ND6 T14318C

11、和C14340T位于基質(zhì)區(qū),而且ND6G14226A在對照組未發(fā)現(xiàn)。當(dāng)攜帶ND6G14226A時,第5跨膜區(qū)的N端由145位變?yōu)?50位,C端由167位變?yōu)?71,其長度由23個氨基酸縮短為22個。當(dāng)攜帶ND6T14318C時,增加了1個跨膜區(qū),增加的跨膜區(qū)為N端109位到C端131位,共23個氨基酸。當(dāng)攜帶ND6 C14340T時,第4跨膜區(qū)的C端由106位變?yōu)?05位,長度縮短了一個氨基酸。
  結(jié)論:
  1.1638

12、例受試樣本中,線粒體ND6攜帶了大量基因變異,大部分可能為線粒體DNA多態(tài)性位點,但是ND6基因G14207A、G14226A、G14258A、C14272G、 A14280G、T14318C、T14319C、T14325C、C14334T、 C14337T、C14340T、G14364A、A14496G、T14502C、T14550C及T14598C基因變異可能提高了EH患病的易感性。
  2.線粒體ND6C14272G,A14

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