食源性金黃色葡萄球菌腸毒素基因檢測(cè)和基因分型研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、目的:
   1建立食源性金黃色葡萄球菌14種腸毒素基因的多重PCR檢測(cè)方法,調(diào)查石家莊地區(qū)食源性金葡菌中腸毒素基因的分布狀況。
   2設(shè)計(jì)食源性金葡菌的MLVA分型方法,比較MLST、MLVA、PFGE三種基因分型方法在食源性金葡菌基因多樣性研究中的優(yōu)劣勢(shì)。
   方法:
   1對(duì)93株食源性金葡菌進(jìn)行復(fù)蘇傳代培養(yǎng),用試劑盒提取基因組DNA;
   2設(shè)計(jì)14種腸毒素基因A、B、C、D、E、

2、G、H、J、K、L、M、N、Q、U的PCR引物,通過(guò)優(yōu)化反應(yīng)條件確定多重PCR反應(yīng)體系,對(duì)石家莊地區(qū)分離的93株食源性金葡菌進(jìn)行腸毒素基因的檢測(cè);
   3參考相關(guān)文獻(xiàn),結(jié)合網(wǎng)站數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)金葡菌的MLVA分型方法。應(yīng)用MLST、MLVA、PFGE三種方法分別對(duì)26株食源性金葡菌進(jìn)行基因分型,對(duì)分型結(jié)果進(jìn)行對(duì)比分析。
   結(jié)果:
   193株食源性金葡菌均成功復(fù)蘇,提取的基因組DNA濃度和純度均符合實(shí)驗(yàn)需求。

3、r>   2設(shè)計(jì)的14種腸毒素基因PCR引物除SEE外,均擴(kuò)增到了目的基因片段,雙向測(cè)序結(jié)果在GeneBank上進(jìn)行BLAST比對(duì),證實(shí)為腸毒素基因的目的片段。
   3設(shè)計(jì)優(yōu)化的多重PCR反應(yīng)體系能夠成功擴(kuò)增到食源性金葡菌的腸毒素基因目的片段,經(jīng)檢測(cè),93株食源性金葡菌中79株檢出含有腸毒素基因,腸毒素基因的檢出率為84.95%;其中檢出SEA的有55株(59.14%),SEG32株(34.41%),SEM32株(34.41

4、%),SEK25株(26.88%),SEB22株(23.66%),SEU21株(22.58%),SEN20株(21.51%),SEH16株(17.20%),SEJ15株(16.13%),SEC14株(15.05%),SED13株(13.98%),SEQ13株(13.98%),SEL7株(7.53%);此外,57株金葡菌(61.29%)被檢出同時(shí)含有兩種或兩種以上腸毒素基因,其中有1株檢測(cè)到同時(shí)含有10種腸毒素基因,3株檢測(cè)到同時(shí)含有9種

5、,3株檢測(cè)到同時(shí)含有8種。
   4MLST分型將26株金葡菌分成8個(gè)ST序列型,其中ST59型11株,均來(lái)自同一起食物中毒分離獲得的菌株;ST5型5株,ST464型3株,ST7型和ST15型各2株;此外還獲得了一個(gè)新發(fā)現(xiàn)的ST序列型,已提交MLST國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行確認(rèn)并收錄。
   5設(shè)計(jì)的MLVA方法具有較好的分型力和可重復(fù)性,26株食源性金葡菌經(jīng)此方法成功分為10個(gè)基因型,其中VA05型11株,均為一起食物中毒中分離

6、的菌株,VA07型4株,VA01型、VA09型和VA10型各兩株,其他各一株。
   6PFGE分型將26株金葡菌分為9組共13個(gè)基因型,其中A組共11株,均為一起食物中毒中分離的菌株,B組有4個(gè)亞型共4株,C組有兩個(gè)亞型共3株,D組和E組各兩株,其他組各一株。
   結(jié)論:
   1設(shè)計(jì)的14種腸毒素基因PCR引物以及多重PCR反應(yīng)體系具有較好的穩(wěn)定性,能夠用于食源性金黃色葡萄球菌腸毒素基因的快速檢測(cè)。

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