開發(fā)中國人藥物基因組信息庫及觀察早期腎移植術(shù)后病人CYP3A和ABCB1基因多態(tài)對環(huán)孢素A藥代動力學(xué)的影響.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、自從人類基因組計劃實施以來,生物信息學(xué)得到了迅猛發(fā)展。它主要是利用數(shù)學(xué)、信息學(xué)、統(tǒng)計學(xué)、計算機等學(xué)科來研究生物學(xué)的問題,是分子生物學(xué)與信息技術(shù)(尤其是互聯(lián)網(wǎng)技術(shù))的結(jié)合體。其研究材料是基于計算機的海量生物學(xué)數(shù)據(jù),其方法就是對生物學(xué)數(shù)據(jù)的收集、篩選、編輯、整理、管理、顯示、計算及模擬。
  生物信息學(xué)極大的影響了基因組學(xué)的一個分支學(xué)科——藥物基因組學(xué)。在它的影響下,藥物基因組學(xué)以前所未有的速度發(fā)展。然而,藥物基因組學(xué)研究所產(chǎn)生的試驗

2、數(shù)據(jù)大多是分散和無結(jié)構(gòu)化的,所以生物學(xué)家們要想獲取集中有序的數(shù)據(jù)異常艱難。如果建立各種便于訪問的藥物基因組數(shù)據(jù)庫則可以有效的解決這一問題。因此,我們研發(fā)了中國人藥物基因組信息庫(CPGxNet)。
  此外,我們還進行了一項關(guān)于早期腎移植術(shù)后病人CYP3A和ABCB1基因多態(tài)以及其組成的單倍型對環(huán)孢素A藥代動力學(xué)影響的試驗性研究。研究中,我們把CYP3A和ABCB1的分型結(jié)果用一種試探性的推測方法順次和來自Web of Scien

3、ce、CPGxNet數(shù)據(jù)庫中的相關(guān)數(shù)據(jù)進行了比較分析,以此來驗證CPGxNet數(shù)據(jù)庫報表數(shù)據(jù)的可靠性。
  本課題具體研究結(jié)果如下:
  1、開發(fā)了基于瀏覽器朋艮務(wù)器(B/S)架構(gòu)完全免費的CPGxNet數(shù)據(jù)庫,并通過互聯(lián)網(wǎng)進行正式發(fā)布(網(wǎng)址:http://www.cpgxnet.net/);
  2、CPGxNet數(shù)據(jù)庫目前共收錄5個基因,98個單核苷酸多態(tài)位點(SNP),124種藥物,1145條中國人藥物相關(guān)基因突

4、變記錄,并還在持續(xù)收錄中;
  3、本數(shù)據(jù)庫中國人樣本集信息以及由此的報表功能目前還未發(fā)現(xiàn)類似藥物基因組數(shù)據(jù)庫涉及,經(jīng)分析驗證可以認為這一模塊對研究人員具有一定的參考價值,即可以幫助科研人員弄清楚當(dāng)前藥物基因組學(xué)在中國人方面的研究熱點,比如涉及的種族、地域、大小、頻率、表型、研究時間等;
  4、我們把試驗分型數(shù)據(jù)(CYP3A4*1G、CYP3A5*3C、ABCB11236C>T、2677G>T/A和3435C>T的突變頻率

5、分別為26.2%、69%、65.5%、42.5%/14.3%和38.9%)和來自Web of Science、CPGxNet數(shù)據(jù)庫的相關(guān)結(jié)果進行比較,驗證了CPGxNet數(shù)據(jù)庫生成報表數(shù)據(jù)的可靠性,提示了CPGxNet數(shù)據(jù)庫具有一定的參考價值;
  5、我們把對數(shù)據(jù)庫驗證的分型數(shù)據(jù)通過單基因分析,進一步觀察到CYP3A5*3C多態(tài)性與CYP3A5-CYP3A5 AA單倍型和早期腎移植病人服用CsA的藥代動力學(xué)具有相關(guān)性(P<0.0

6、5),而未發(fā)現(xiàn)CYP3A4*1G、ABCB11236C>T、ABCB12677G>T/A和ABCB13435C>T多態(tài)性以及CYP3A4-CYP3A5 GG、ABCB11236-2677-3435TTT、CGC和TGC單倍型和病人的CsA藥代動力學(xué)有相關(guān)性(P>0.05);
  6、我們?yōu)榱舜_定CYP3A5*3C是否作為獨立因素影響藥物CsA的藥代動力學(xué),我們以CYP3A5*3C、年齡、血紅蛋白、血尿素氮和血肌酐為自變量構(gòu)建的多元

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