番茄WRKY轉錄家族生物信息學分析及部分抗逆相關基因鑒定.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、番茄具有豐富的營養(yǎng)價值、較強的適應能力、栽培很容易以及很高的產(chǎn)量等特點,因此,番茄是一種重要的世界性蔬菜,在蔬菜生產(chǎn)中占有主要地位。但是番茄在生長的過程中,通常會受惡劣自然環(huán)境的影響,導致產(chǎn)量的下降,因此研究逆境脅迫對番茄生長的影響,有著重要的意義。本文主要對番茄與抗逆相關的轉錄因子WRKY家族進行了全基因組挖掘及生物信息學分析,并且通過對部分基因在逆境脅迫下的表達模式進行研究,獲得了該家族中與番茄抗逆應答相關的基因。
  1通過

2、生物信息學分析,鑒定出了番茄WRKY家族包含81個成員,按其WRKY結構域及鋅指結構分為3族,第二族按其氨基酸順序又可以分為5個亞族。除番茄的11號染色體沒有WRKY轉錄因子,其他染色體上均有分布。僅SlWRKY19,SlWRKY20倆個家族成員不含內含子,其他成員都含有2~5個內含子。番茄WRKY結構域是高度保守的,僅有10個WRKYGQK發(fā)生了變異,占WRKY家族的10%。
  2對6個典型WRKY轉錄因子進行組織特異性表達模

3、式分析,發(fā)現(xiàn)這些基因在根、莖、葉、花、果中均有表達,但不同基因在同一組織中的表達量存在差異,同一基因在不同組織中的表達量也存在差異,SlWRKY13和SlWRKY24在根和花中的表達量較高,在莖中幾乎不表達;SlWRKY31在根、莖、葉中的表達量大于花和果;SlWRKY50在根、葉、花中的表達量較高,在莖中幾乎不表達;SlWRKY62在根、葉、果中的表達量較高,在莖中幾乎不表達;SlWRKY63在根中的表達量最高,在莖和果中幾乎不表達。

4、
  3在鹽脅迫處理中,SlWRKY13、SlWRKY31、SlWRKY50、SlWRKY62和SlWRKY63基因的表達水平呈現(xiàn)先上升,然后逐漸下降的趨勢,而SlWRKY24基因的表達則顯著下調;在干旱脅迫處理中,SlWRKY13、SlWRKY31、SlWRKY62和SlWRKY63基因表達上調,SlWRKY24和SlWRKY50基因表達下調;在低溫脅迫處理中,SlWRKY13、SlWRKY31、SlWRKY50、SlWRKY6

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