1、浙江大學(xué)博士學(xué)位論文三種核型多角體病毒基因組學(xué)分析姓名：馬秀翠申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：農(nóng)業(yè)昆蟲與害蟲防治指導(dǎo)教師：張傳溪20061001浙江大學(xué)博士學(xué)位論文列構(gòu)成。根據(jù)基因的同源性和基因?qū)Φ扰帕?genep撕typlots)情況，Eco蚧呼V與GmupⅡNPV最為接近。3H∞r(nóng)NPvC1株基因組全序列分析測定了He甜岍V￡l基因組全序列并與He砌岬V如4進(jìn)行了比較分析。=者感染相同的宿主并具有相同的地理分布，但對(duì)宿主的毒力不同。Hem岬

2、V℃l基因組大小為130，759bp，GC含量為389％，含有137個(gè)推測的oRF。兩種基因組核菅酸序列的相似性為981％。與He砷岬vG4相比，Head岬V￡1中共有555bp的替代，1354bp的缺失及710bp的插入對(duì)兩種基因組的OI強(qiáng)和同源區(qū)(hr)進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn)，兩種基因組的不同點(diǎn)主要發(fā)生在四個(gè)高度變化的區(qū)域，包括11r1，hr4，l】r5和brob。所有上述變化均發(fā)生在重復(fù)區(qū)。分析結(jié)果表明，桿狀病毒的種群或品系之間的差異經(jīng)常是

3、由單核苷酸多態(tài)性(sNPs)及hr和bro基因的變化所造成的。4EupsNPV基因組全序列分析對(duì)EupsNPV的全基因組序列進(jìn)行了分析，并與其他幾種桿狀病毒的基因組做了比較。E印s1岬V基因組全長為140，620bp，堿基組成中GC含量為404％。該基因組含有139個(gè)推測的ORF，其中13個(gè)ORF為Eup心岬V所特有。編碼區(qū)和非編碼的序列分別為124，275和14，664卻，分別占整個(gè)基因組的895％和105％。在EupsNPV基因組中

4、存在4個(gè)11r，不同lr問的重復(fù)序列各不相同。該基因組中有3個(gè)基因各含有2個(gè)拷貝，包括bm，印6和dbp，且每個(gè)基因中的兩個(gè)拷貝來源不同。比較分析表明，EupsNPV與GroupⅡNPV較為類似，其中與EcobNPV的親緣關(guān)系最近，同時(shí)該基因組有自己獨(dú)特的組織特性。5EupsNPV、EeobNPV和HearNPVC1基因組比較分析對(duì)EupsNPv、EcobNPv和Hearl岬、Lcl的基因組結(jié)構(gòu)及進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行了比較分析。三種病毒的基因組

5、大小接近，GC含量相似。三個(gè)基因組共有的ORF為102個(gè)，其中包括30個(gè)桿狀病毒核心基因。EupsNPV與EcobNPV之間氨基酸的平均同源性為46％，高于EupsNPV和HearNPV℃1之間氨基酸的平均同源性(38％)。它們均不含有GroupINPV所特有的印耐囊膜蛋白基因在Eup由岬V與EcobNPV的比較中，無論是EupsNPV還是EcobNPv的特有ORF數(shù)目都少于其與He耐岬vcl比較時(shí)各自特有的ORF數(shù)。三種基因組同源區(qū)O