血清蛋白質(zhì)譜結(jié)合人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在胃癌診斷中的研究.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:因早期癥狀不明顯,大部分胃癌患者就診時(shí)已是中晚期。尋找能早期發(fā)現(xiàn)和診斷胃癌的標(biāo)志物已成為目前臨床和基礎(chǔ)研究的主要方向。近年來(lái)表面增強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(SELDI—TOF—MS)技術(shù)已在許多腫瘤標(biāo)志物研究中應(yīng)用并取得成功。本研究應(yīng)用血清蛋白質(zhì)譜技術(shù)結(jié)合人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建立胃癌患者的診斷模型,并評(píng)價(jià)其診斷價(jià)值。 方法:對(duì)84例胃癌患者和75例對(duì)照者(胃潰瘍31例,慢性萎縮性胃炎20例,健康人群24例)的血清樣本隨機(jī)分為訓(xùn)練

2、集(共106例,54例胃癌患者和52例對(duì)照)和測(cè)試集(共53例,30例胃癌患者和23例對(duì)照),以上研究對(duì)象均經(jīng)胃鏡及組織活檢明確診斷,所有胃癌患者在胃鏡檢查之前均未進(jìn)行任何形式的腫瘤治療,所有血清樣本均在研究對(duì)象空腹時(shí)采集,并以—80℃凍存?zhèn)溆?。另?0份正常人血清進(jìn)行混合,制成混合對(duì)照血清,分裝后—80℃保存。首先應(yīng)用表面加強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)及弱陽(yáng)離子交換表面(CM10)蛋白芯片檢測(cè)所研究樣本及混合對(duì)照血清,利用Ciphe

3、rgen Proteinchip軟件對(duì)獲得的混合對(duì)照血清圖譜進(jìn)行分析并計(jì)算其差異性,以變異系數(shù)(CV)值表示,設(shè)定CV<15%時(shí),滿足蛋白質(zhì)譜檢查可重復(fù)性的要求。采用Biomarker Wizard3.1軟件分析患者組和對(duì)照組血清蛋白指紋圖譜,兩組間蛋白質(zhì)峰值比較時(shí),對(duì)初步篩選的蛋白質(zhì)峰進(jìn)行t檢驗(yàn),P<0.01的蛋白質(zhì)峰差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)合反向傳播人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的方法利用訓(xùn)練集建立診斷模型。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)根據(jù)訓(xùn)練集中的輸入數(shù)據(jù)和輸出數(shù)據(jù)

4、,學(xué)習(xí)和記憶數(shù)據(jù)之間的內(nèi)部聯(lián)系。一旦人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型被建立,它可分析新輸入數(shù)據(jù)而預(yù)測(cè)輸出結(jié)果。使用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型檢測(cè)測(cè)試集樣本并評(píng)價(jià)該模型的診斷價(jià)值。 結(jié)果:1)對(duì)混合對(duì)照血清中所得蛋白質(zhì)譜圖進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果CV值為13.50%。為避免基質(zhì)峰可能存在的干擾,將2000M/Z以下的峰濾去。2)對(duì)胃癌患者和對(duì)照組血清進(jìn)行分析,共檢測(cè)到722個(gè)蛋白質(zhì)峰,統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果顯示214個(gè)蛋白質(zhì)峰P直<0.01。3)在214個(gè)具有明顯表達(dá)差異

5、的蛋白峰中,利用訓(xùn)練集樣本,以質(zhì)荷比(M/Z)分別為2175、2249、2927、3217、3236、3287、3545、6190和6450的9個(gè)蛋白質(zhì)峰作為標(biāo)志蛋白建立人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型,正確地區(qū)分開(kāi)了訓(xùn)練集中胃癌患者和對(duì)照者。4)利用建立的模型對(duì)測(cè)試集中樣本進(jìn)行盲法測(cè)試,結(jié)果顯示:30例胃癌患者中有3例判錯(cuò);而在23例對(duì)照中出現(xiàn)2例判錯(cuò),其對(duì)胃癌的診斷靈敏度和特異度分別為90.0%和91.3%。 結(jié)論:1)表面加強(qiáng)激光解吸

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