1、基因芯片分析能在基因組水平上檢測基因表達譜。基因芯片分析產生的大規(guī)模數(shù)據對了解植物分子生理機制提供了幫助。目前技術最為可靠，應用最為廣泛的芯片平臺是水稻Affymetrix57K全基因組表達譜芯片。我們已經開發(fā)了RiceDB一個基于Web界面的在生物學背景下注釋水稻基因芯片的整合數(shù)據庫，它的注釋信息比同類針對水稻Affymetrix57K全基因組表達譜芯片的注釋數(shù)據庫更全面，更快捷，且可以自動更新。它由八個功能模塊組成，RiceMap建

2、立水稻Affymetrix57K探針組與基因的對應關系，從而提供來自各個水稻生物信息學數(shù)據庫功能描述信息；RiceGO整合GeneOntology數(shù)據庫從分子功能，生物學途徑和分子功能三個方向上來對Affymetrix57K探針組進行注釋；RiceKO確定Affymetrix57K探針組代表的基因可能參與的代謝路徑與調控；RiceUP、RiceDO、RiceMR、RiceCD、RiceGF分別確定Affymetrix57K探針組代表的基