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文檔簡(jiǎn)介
1、羽色是禽類(lèi)重要的經(jīng)濟(jì)性狀和遺傳標(biāo)記,在確定品種的親緣關(guān)系和培育優(yōu)質(zhì)的品系等方面具有重要作用。為了探索鴨羽色變異的基因調(diào)控機(jī)理,本研究以連城白鴨與白改鴨雜交后的F2代資源群體以及莆田黑鴨、恩施麻鴨、連城白鴨、白改鴨、荊江麻鴨、櫻桃谷鴨作為研究對(duì)象,以影響黑色素合成和轉(zhuǎn)運(yùn)的相關(guān)基因(KIT基因、ASIP基因、ATRN基因及RAB27A基因)作為候選基因,采用5'RACE、熒光定量PCR以及單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)等方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn),主要研究結(jié)果如下:
2、
1.通過(guò)對(duì)鴨KIT基因的5'RACE研究發(fā)現(xiàn)該基因mRNA存在3種不同的剪接體(剪接體1,2和3)。其中剪接體1與其他禽類(lèi)KIT基因第一外顯子序列高度相似,但是與鴨KIT基因mRNA參考序列(登錄號(hào):XM013093147.1)不同;剪接體2是鴨KIT基因第二內(nèi)含子的部分序列與第三外顯子的剪接產(chǎn)物;剪接體3是鴨KIT基因外顯子按照4-5-6-7-2-3-4順序剪接的產(chǎn)物。
2.通過(guò)DNA walking、熒光定量P
3、CR等實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)KIT基因是鴨基因組上的多拷貝基因,其拷貝數(shù)在不同羽色鴨群中差異不顯著,推測(cè)KIT基因的拷貝數(shù)與鴨羽色變異無(wú)關(guān)。
3.通過(guò)對(duì)鴨KIT基因的多態(tài)性研究及其與羽色的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn):(1)鴨KIT基因第一內(nèi)含子上存在1段8 bp的缺失變異,并且該缺失在白羽及有色羽鴨群體中的分布差異不顯著(P>0.05);(2)在該基因的第一內(nèi)含子上發(fā)現(xiàn)18個(gè)SNP位點(diǎn),其中11個(gè)產(chǎn)生酶切位點(diǎn)的改變,酶切關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明g.912C>G和
4、g.6578G>A位點(diǎn)的3種基因型在白羽和有色羽群體中的分布差異顯著(P<0.05)。
4.通過(guò)對(duì)鴨ASIP基因多態(tài)性的研究發(fā)現(xiàn):(1)鴨ASIP基因上存在5個(gè)SNP位點(diǎn),但這5個(gè)位點(diǎn)均未產(chǎn)生酶切位點(diǎn)的改變;(2) ASIP基因上存在11bp的缺失變異,并且該缺失在白羽及有色羽鴨群體中的分布差異不顯著(P>0.05);(3)通過(guò)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)ASIP基因是鴨基因組上的多拷貝基因,其拷貝數(shù)在不同羽色鴨群間差異不顯著,推測(cè)
5、ASIP基因的拷貝數(shù)與羽色變異無(wú)關(guān)。
5.對(duì)連城白鴨與白改鴨雜交F2代資源群體(n=1030)的羽色分離情況進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn)其中只有4個(gè)與親代連城白鴨黑喙白羽黑蹼性狀相同的個(gè)體,該性狀的個(gè)體約占總?cè)后w的(1/4)4,推測(cè)連城白鴨的黑喙白羽黑蹼性狀由4個(gè)位點(diǎn)上的基因控制。通過(guò)對(duì)鴨ATRN和RAB27A基因多態(tài)性的研究發(fā)現(xiàn):(1)鴨ATRN基因存在一段29bp的缺失變異以及一個(gè)SNP位點(diǎn)g.546T>C,并且這兩種變異在連城白鴨與
6、第二世代黑喙白羽黑蹼個(gè)體中均為純合,而在白改鴨中表現(xiàn)為多態(tài);(2)鴨RAB27A基因存在一個(gè)SNP位點(diǎn)g.634T>A,該位點(diǎn)在親代連城白鴨和第二世代黑喙白羽黑蹼個(gè)體中的基因型均為T(mén)T型,而在白改鴨中表現(xiàn)為多態(tài),因此推測(cè)ATRN、RAB27A基因是可能調(diào)控連城白鴨黑喙白羽黑蹼性狀的兩個(gè)相關(guān)基因。
綜上所述:KIT基因變異可能與鴨羽色性狀相關(guān),ASIP基因變異可能與鴨羽色性狀不相關(guān),ATRN基因和RAB27A基因可能與連城白鴨黑
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