IgA腎病臨床危險(xiǎn)因素和基因組學(xué)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、IgA腎病(IgAN)是亞洲人終末期腎臟病(ESRD)的常見原因,屬復(fù)雜性疾病,臨床表現(xiàn)及預(yù)后差異很大。本研究目的:1)通過對(duì)大組中國人IgAN患者的研究,建立新的臨床風(fēng)險(xiǎn)模型,有效預(yù)測IgAN患者預(yù)后(ESRD);2)通過對(duì)大組中國、歐洲和北美人IgAN患者進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),尋找到新的IgAN易感基因及位點(diǎn);3)通過拷貝數(shù)變異(CNV)研究,試圖發(fā)現(xiàn)GWAS研究所定位易感位點(diǎn)的功能變異。我們致力于建立全新的遺傳易感性模

2、型,增進(jìn)對(duì)該病的了解。
   首先,本研究回顧性分析經(jīng)腎活檢確診的619例IgAN患者,以ESRD為研究終點(diǎn),記錄基線及隨訪臨床指標(biāo),平均隨訪時(shí)間為41.3個(gè)月。隨訪期間共67位患者達(dá)到研究終點(diǎn)需行腎臟替代治療。我們建立Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型,經(jīng)完全校正后,發(fā)現(xiàn)五個(gè)基線變量為發(fā)生ESRD的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,這些危險(xiǎn)因素包括:評(píng)估腎小球?yàn)V過率(eGFR)[HR=0.96(0.95-0.97)],血清白蛋白[HR=0.48(0.33-0.7

3、2)],血紅蛋白[HR=0.80(0.72-0.89)],收縮壓[HR=1.02(1.00-1.03)]以及Haas分型[HR=4.54(1.30-15.90)]?;谶@5個(gè)變量,我們建立了一個(gè)計(jì)算臨床危險(xiǎn)評(píng)分的模型。此危險(xiǎn)評(píng)分可以解釋研究終點(diǎn)差異的23%,進(jìn)一步應(yīng)用受試者工作特征曲線(ROC)比較該危險(xiǎn)評(píng)分與之前推薦應(yīng)用的危險(xiǎn)評(píng)分相比較,發(fā)現(xiàn)本研究建立的危險(xiǎn)評(píng)分能更好預(yù)測不同時(shí)間點(diǎn)(24個(gè)月、60個(gè)月、和120個(gè)月)患者的預(yù)后( ES

4、RD)??傊狙芯拷Y(jié)果顯示基礎(chǔ)eGFR較低、血紅蛋白較低、血清白蛋白較低、基礎(chǔ)收縮壓較高和病理損害較嚴(yán)重的IgA患者進(jìn)展為ESRD的風(fēng)險(xiǎn)高?;谝陨衔鍌€(gè)基礎(chǔ)變量建立新的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分系統(tǒng)為對(duì)IgAN患者進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)分層提供了一個(gè)簡單的方法。
   其次,我們對(duì)大組中國、歐洲和北美人IgaN進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)。本研究第二部分入選IgAN患者及健康人共5966人,其中發(fā)現(xiàn)組標(biāo)本來自中國北方(北京),包括1194例IgAN患者和

5、902例健康人,驗(yàn)證組分別來自中國南方(上海)(740例患者,750例健康人),歐洲和北美(1273例患者,1201例健康人)。結(jié)果顯示,共5個(gè)獨(dú)立易感位點(diǎn)與IgAN顯著相關(guān),其中3個(gè)在主要組織相容性復(fù)合物(MHC)區(qū)域(p-values:1.59 x I0-26,-4.84 x10.9,OR=0.63-0.80),1個(gè)位于1q32(包含一個(gè)常見缺失CFHRI3),一個(gè)在22q12。結(jié)合這5個(gè)易感位點(diǎn)建立遺傳易感模型,共可解釋4-7%的

6、疾病發(fā)生,高風(fēng)險(xiǎn)較低風(fēng)險(xiǎn)個(gè)體IgAN發(fā)病率可增高10倍。此外,這些IgAN危險(xiǎn)性等位基因的頻率在亞洲人最高、歐洲人其次、非洲人最低,與該病的發(fā)病率平行,這一發(fā)現(xiàn)提示存在復(fù)雜的自然選擇壓力。
   因?yàn)镚WAS發(fā)現(xiàn)在1號(hào)染色體1q32補(bǔ)體H因子(CFH)所在區(qū)域與IgA腎病(IgAN)呈現(xiàn)明顯相關(guān)性。該區(qū)域的最強(qiáng)信號(hào)來自rS6677604,與一個(gè)常見的包含CFHR1和CFHR3的染色體缺失(CFHR1,3a)顯著相關(guān)。本研究第三部

7、分目的為(1)通過直接檢測CFHR1,3研究該染色體缺失是否是CFH區(qū)域與IgAN關(guān)聯(lián)的功能變異:(2)尋找該區(qū)域是否存在其他與IgAN相關(guān)的罕見變異。本研究納入1929經(jīng)腎活檢確診的原發(fā)性IgAN和1652例健康人,所有研究對(duì)象均為中國漢族人。我們首先對(duì)該區(qū)域的6個(gè)基因(CFH,CFHRl-5)進(jìn)行編碼區(qū)測序,未發(fā)現(xiàn)有意義的變異,其次通過多重連接依賴的探針擴(kuò)增(MLPA)技術(shù)和定量PCR(qPCR)方法對(duì)所有研究對(duì)象進(jìn)行拷貝數(shù)變異(C

8、NV)的檢測,應(yīng)用PLINK v1.07和UNPHASED3.1.3對(duì)CNV結(jié)果進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。我們發(fā)現(xiàn),CFHR1,3A和rs6677604變異存在高度連鎖不平衡(r2=0.90,D’=0.98),二者均與IgAN存在明確的相關(guān)性(rs6677604:OR=0.60,p=1.510-6;CFHR1,3A:OR=0.56,p=4.6*10"s)。當(dāng)我們以rs6677604為協(xié)變量作條件回歸,CFHR1,3A仍然具有獨(dú)立的IgAN保護(hù)作用(

9、OR=0.44,95%CI:0.24-0.83,p=0.01)。相反,當(dāng)我們以CFHR1,3為協(xié)變量作條件回歸,rs6677604的顯著性則消失(OR=1.23,P=0.28)。此外,我們還發(fā)現(xiàn)了3個(gè)罕見的單基因拷貝數(shù)變異(CFHR3A,CFHRIA和CFHRI duplication,freq=0.6-2%),但這些CNV與IgAN的發(fā)病無相關(guān)性。由于我們發(fā)現(xiàn)CFHR1,3可解釋rs6677604與IgAN的相關(guān)性,強(qiáng)烈提示該染色體缺

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