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![玉米籽粒發(fā)育相關基因ZmMADS-RIN的克隆及表達分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/37be45e6-ff8b-4144-8b78-a2b4c4530bc6/37be45e6-ff8b-4144-8b78-a2b4c4530bc61.gif)
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文檔簡介
1、玉米產量是一個復雜的數(shù)量性狀,主要由粒數(shù)和粒重組成,而籽粒的形狀和大小均能影響粒重,進而影響產量。因此,克隆控制玉米籽粒發(fā)育的基因,分析玉米籽粒的發(fā)育及產量之間的關系,對于玉米產量的遺傳和分子機制的研究具有重要的生物學意義。
本研究以玉米骨干自交系鄭58的籽粒為材料,采用同源克隆法得到了一個玉米籽粒發(fā)育相關的基因ZmMADS-RIN。利用生物信息學技術對其編碼的蛋白進行了分析,應用RT-PCR方法研究其特異性表達,實時熒光定量
2、PCR方法研究其表達規(guī)律。主要的研究結果如下:
1、測序結果分析表明,該基因的cDNA全長859bp,開放閱讀框為768bp,將其與玉米B73中所對應的cDNA的編碼區(qū)序列相比,共有6個SNPs位點的差異,對應的氨基酸序列有3個氨基酸殘基發(fā)生了變化。
2、生物信息學分析表明,ZmMADS-RIN蛋白的相對分子量為29.23kD,理論等電點(pI)為8.84,是一種親水性蛋白,不含信號肽序列,也不含跨膜結構;具有5個磷
3、酸化位點;其二級結構顯示,該蛋白含有50.20%的α-螺旋(Alpha helix)、27.45%的無規(guī)則卷曲(Random coil)、14.51%的延伸鏈(Extended strand)和7.84%的β-轉角(Beta turn);亞細胞定位預測結果顯示,該蛋白位于細胞核內;對ZmMADS-RIN蛋白的序列分析表明,ZmMADS-RIN基因的氨基酸序列含有高度保守的MADS結構域、相對保守的K結構域、低保守的I結構域和最不穩(wěn)定的C
4、結構域,是典型的MIKC型MADS-box蛋白;系統(tǒng)進化樹分析表明,ZmMADS-RIN蛋白屬于AGL6分枝,與水稻基因OsMADS6的相似性最高,為89%。
3、對玉米自交系鄭58的ZmMADS-RIN基因進行的組織特異性表達分析結果表明,該基因在玉米籽粒中高度表達,在根及不同時期的葉片中沒有檢測到表達信號。
4、實時熒光定量PCR結果顯示,ZmMADS-RIN基因的表達量在玉米籽粒發(fā)育的不同階段呈現(xiàn)一定規(guī)律的變化
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