1、上海交通大學博士學位論文人源菌群仔豬模型的建立及其分子生態(tài)學研究姓名：龐小燕申請學位級別：博士專業(yè)：生物化學與分子生物學指導教師：趙立平20051001上海交通人學博士學位論文摘要個體被選定為建立HFA仔豬模型的供體)的腸道擬桿菌TGGE條帶所代表的擬桿菌種類進行了確認。這些條帶代表的序列在GenBank中分別與脆弱擬桿菌(Bacteroidesfragilis)、普通擬桿菌@v比忉ms)、糞擬桿菌假caccae)、單形擬桿菌阻unif

2、ormis)、擬桿菌亞種阻sp)AR20同源性最高。分析中還發(fā)現(xiàn)了3種可能代表擬桿菌新種的DNA序列。這種新發(fā)展的擬桿菌類群特異性PCRTGGE技術簡便、重復性強，可實現(xiàn)對大量人和動物腸道內擬桿菌組成的快速、準確分析以及動態(tài)監(jiān)測。按照同樣的方法、思路，本研究也對人腸道中與健康密切相關的雙歧桿菌的組成進行了分析，同樣也發(fā)現(xiàn)不同健康人腸道中雙歧桿菌的組成有宿主特異性。對選定為HFA仔豬模型的供體的腸道雙歧桿菌的組成分析顯示，該個體腸道內含有

3、兩權雙歧桿菌(Bifidobacteriumbifidum)、嬰兒雙歧桿菌阻infantis)、長雙歧桿菌∞10ngum)、青春雙歧桿菌但adolescentis)、假小鏈雙歧桿菌僻pseudocatenulatum)及一種可能的新種，其中假小鏈雙歧桿菌為最優(yōu)勢的種類，占雙歧桿菌總數(shù)的513％。青春雙歧桿菌和兩權雙歧桿菌也是該個體腸道內雙歧桿菌的主要類型，各占20％和188％。較之傳統(tǒng)的培養(yǎng)方法，這種基于雙歧桿菌特異性PCR基礎上的TG

4、GE分析技術更為靈敏、直觀。以上這兩種針對擬桿菌和雙歧桿菌的分子分析方法的建立，不僅有助于了解健康人腸道中這兩類重要菌群的組成，也為下面對比和分析HFA仔豬腸道菌群的組成特點提供了一種可行的方法體系。我們選用一10歲健康兒童(男)為構建HFA仔豬模型的供體，采集該個體的新鮮糞便樣品制備菌懸液，接種飼養(yǎng)于恒溫、恒濕的高效空氣過濾屏障系統(tǒng)的剖腹產仔豬。通過4窩剖腹產仔豬共28頭個體的飼養(yǎng)實驗，本研究建立了使剖腹產無菌仔豬腸道中定植人腸道菌群