![](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/12/e95332b1-8dbb-416a-b1a1-dd1f0873651b/e95332b1-8dbb-416a-b1a1-dd1f0873651bpic.jpg)
![有監(jiān)督的主成分分析及偏Cox回歸模型在基因數(shù)據(jù)生存預(yù)測(cè)中的應(yīng)用.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/12/e95332b1-8dbb-416a-b1a1-dd1f0873651b/e95332b1-8dbb-416a-b1a1-dd1f0873651b1.gif)
版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶(hù)提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、目的:基因表達(dá)數(shù)據(jù)存在著高維度、強(qiáng)相關(guān)以及小樣本的特點(diǎn),不滿足經(jīng)典的統(tǒng)計(jì)方法的要求。因此用傳統(tǒng)的Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型進(jìn)行基因數(shù)據(jù)的生存分析存在困難。有監(jiān)督的主成分回歸和偏Cox回歸方法將降維方法與Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型相結(jié)合,可以解決高維生物信息數(shù)據(jù)的生存預(yù)測(cè)問(wèn)題。我們?cè)噲D通過(guò)模擬研究以及實(shí)例分析更好的揭露死亡時(shí)間(或者其它健康事件結(jié)局的時(shí)間)和基因數(shù)據(jù)之間的關(guān)系,為病人得到更精確的預(yù)后和改進(jìn)治療策略提供合理的方法學(xué)依據(jù)。
方法
2、:介紹有監(jiān)督的主成分分析和偏Cox回歸模型的基本原理以及方法步驟。針對(duì)基因數(shù)據(jù)的協(xié)變量個(gè)數(shù)大于樣本例數(shù),以及變量間存在相關(guān)性等特點(diǎn)進(jìn)行模擬研究,并對(duì)國(guó)際上公開(kāi)的三個(gè)基因數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析,考察兩種模型的預(yù)測(cè)性能。采用R軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)模擬,MATLAB7.1進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
結(jié)果:以deviance偏差和決定系數(shù)R2作為模型預(yù)測(cè)性能的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn),從模擬實(shí)驗(yàn)中我們看到,隨著影響生存的基因塊的方差的增大及組內(nèi)相關(guān)系數(shù)ρ的增高,兩種方法的預(yù)
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶(hù)所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶(hù)上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶(hù)上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶(hù)因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 基于主成分分析的Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型在血液透析預(yù)后中的應(yīng)用.pdf
- spss在主成分分析中的應(yīng)用
- 主成分分析在能力驗(yàn)證中的應(yīng)用.pdf
- 主成分分析在綜合評(píng)價(jià)中的應(yīng)用
- 生存分析的cox回歸模型案例spss
- 面板數(shù)據(jù)的主成分分析及其應(yīng)用
- 張量主成分分析及在圖像序列識(shí)別中的應(yīng)用.pdf
- 基于主成分分析和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的癌癥驅(qū)動(dòng)基因預(yù)測(cè)模型.pdf
- 基于主成分分析和偏最小二乘的高爐爐溫預(yù)測(cè)模型的研究.pdf
- 迭代主成分分析在差分功耗分析中的應(yīng)用.pdf
- 19726.生存分析中刪失數(shù)據(jù)比例對(duì)cox回歸模型影響的研究
- 非線性主成分分析方法及其在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用.pdf
- 主成分分析和二項(xiàng)logistic回歸模型的投資價(jià)值對(duì)比分析
- 主成分分析和時(shí)間序列預(yù)測(cè)在我國(guó)就業(yè)人數(shù)研究中的應(yīng)用.pdf
- 懲罰COX模型和彈性網(wǎng)技術(shù)在高維數(shù)據(jù)生存分析中的應(yīng)用.pdf
- 生存分析與cox回歸
- 魯棒主成分分析的優(yōu)化模型及其在計(jì)算機(jī)視覺(jué)中的應(yīng)用.pdf
- 改進(jìn)的魯棒主成分分析模型及其應(yīng)用.pdf
- 基于主成分分析的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型在預(yù)測(cè)老年人認(rèn)知狀態(tài)中的研究.pdf
- ALL患者生存分析應(yīng)用參數(shù)與COX回歸模型對(duì)比研究.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論