利用Bayesian-MCMC方法進行畜禽遠交群數(shù)量性狀和閾性狀QTL定位.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文針對畜禽QTL定位,當采用近交系或遠交系雜交的試驗設計時,資源群體往往很難滿足設計要求;而直接對遠交群進行分析,由于QTL和標記連鎖狀態(tài)的復雜性,統(tǒng)計效率顯著下降,尤其對于閾性狀的分析,由于表型數(shù)據(jù)的不連續(xù)特征和極低的表型方差,進一步加大了遠交群QTL檢測的難度。本研究通過MonteCarlo的試驗方法,采用全同胞家系和全同胞-半同胞混合家系兩種不同試驗設計方案,結合IBD方差組分的隨機模型和Bayesian-MCMC統(tǒng)計方法,分別

2、對數(shù)量性狀和閾性狀進行QTL-標記連鎖分析及相關參數(shù)估計。在分析過程中,對IBD概率矩陣推導的多點法進行了改進(同時考慮包括標記連鎖群起止端點在內的所有標記信息)和擴展(由全同胞推斷擴展到混合家系推斷),采用單MarkovChain抽樣策略和3種抽樣技術(GibbsSampling、Metropolis-HastingsAlgorithm和RJMCMC)產(chǎn)生所有未知目標參數(shù)的后驗樣本,對QTL位置的區(qū)間估計及置信概率、點估計采用QTL強

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