利用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記分析七品種(類型)小型豬的遺傳多樣性.pdf_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

1、采用世界糧農(nóng)組織(FAO)和國(guó)際動(dòng)物遺傳學(xué)會(huì)(ISAG)聯(lián)合推薦的27對(duì)微衛(wèi)星引物,檢測(cè)了七個(gè)中國(guó)地方小型豬種(類型):久仰香豬、劍白香豬、從江香豬、環(huán)江香豬、香豬(貴州省羅灣種豬場(chǎng))、五指山豬、滇南小耳豬及三個(gè)外來豬種:杜洛克、大白豬、長(zhǎng)白豬共計(jì)558個(gè)樣品的基因型,通過計(jì)算等位基因頻率、遺傳雜合度、多態(tài)信息含量、奈氏遺傳距離和奈氏標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離,分析品種內(nèi)和品種間的遺傳變異;采用鄰近結(jié)合法及非加權(quán)組對(duì)算術(shù)平均法,進(jìn)行聚類分析,結(jié)果表明

2、: 1.在23個(gè)微衛(wèi)星座位中,所有位點(diǎn)的平均等位基因數(shù)均大于5,最小平均等位基因數(shù)出現(xiàn)在位點(diǎn)SW951,為5.1,最大平均等位基因數(shù)出現(xiàn)在位點(diǎn)CGA,為15.4,從品種角度分析,五指山豬的平均等位基因數(shù)最高,四類型香豬(久仰、劍白、從江及環(huán)江)的平均等位基因數(shù)最低,在23個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)上的平均等位基因數(shù)均不大于5。 2.7個(gè)國(guó)內(nèi)地方豬種(類型)的平均多態(tài)信息含量(PIC)在0.61~0.84之間,國(guó)外豬種的平均多態(tài)信息含量

3、(PIC)在0.47~0.68之間,差異顯著性檢驗(yàn)(T檢驗(yàn))表明:國(guó)內(nèi)五指山豬、香豬(貴州省羅灣種豬場(chǎng))、滇南小耳豬與三個(gè)外來豬種:杜洛克、大白豬、長(zhǎng)白豬差異顯著(P<0.05)或極顯著(P<0.01),久仰香豬、劍白香豬、從江香豬、環(huán)江香豬與外來豬種間差異顯著(P<0.05)或不顯著(P>0.05)。 3.7個(gè)國(guó)內(nèi)地方豬種(類型)的平均雜合度在0.6679~0.8640之間,劍白香豬最小,為0.6679,五指山豬最大,為0.8

4、640,國(guó)外豬種的平均雜合度在0.4585~0.7169之間,大白豬最小為0.4585,杜洛克最大,為0.7169。 4.結(jié)合平均多態(tài)信息含量及平均雜合度兩個(gè)指標(biāo),10品種(類型)豬的變異程度從大到小依次為:五指山豬、香豬(貴州省羅灣種豬場(chǎng))、滇南小耳豬、杜洛克、環(huán)江香豬、從江香豬、久仰香豬、劍白香豬、長(zhǎng)白豬及大白豬。 5.采用微衛(wèi)星分析品種間的變異程度時(shí)發(fā)現(xiàn),中國(guó)豬種和外來豬種間的遺傳距離較大,相對(duì)大白豬和長(zhǎng)白豬而言,

5、杜洛克與中國(guó)地方豬種的遺傳距離較近,中國(guó)地方豬種同一省份豬種間的遺傳距離較小,不同省份豬種間差異較大。 6.根據(jù)奈氏遺傳距離及奈氏標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離,繪制了10品種(類型)豬的NJ及UPGMA聚類圖,結(jié)果顯示:10品種(類型)豬共分為3大類群,久仰、劍白、從江及環(huán)江香豬聚為第一類,滇南小耳豬、五指山豬、香豬(貴州省羅灣種豬場(chǎng))聚為第二類,國(guó)外豬種聚為第三類;久仰、劍白、從江及環(huán)江香豬單獨(dú)聚為一類,和其余豬種遺傳距離較遠(yuǎn),說明四類型香豬

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